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目的：コンタクトレンズ着用者の感染した角膜と実験室株の感染した角膜から得られた緑膿菌（緑膿菌）の臨床分離株のプロテオームプロファイルを比較する。 方法：標準的な方法を使用して、抗生物質感受性、運動性、バイオフィルム形成、および毒性試験を実施しました。全タンパク質溶解物を3回3回液体クロマトグラフィー/タンデム質量分析（LC-MS/ MS）で分析し、相対タンパク質の存在量をスペクトルカウントで決定しました。統計分析には、統計分析に続くGテストとそれに続く2つの株間のタンパク質の微分発現の有意性を決定するために、統計分析に使用されました。 結果：合計687個のタンパク質が検出されました。133（133）のタンパク質は、2つの株間で有意に異なっていました。これらのうち、13がアップレギュレートされ、16はATCC 10145と比較して臨床株でダウンレギュレートされましたが、57は臨床株でのみ検出されました。上方制御されたタンパク質は、病原性と病原性に関連しています。 結論：緑膿菌の臨床株でより高いレベルで検出されたタンパク質は、毒性因子であることが知られているタンパク質でした。これらの結果は、角膜炎に関連したP. eruginosa株が病原性であり、実験室株ATCC 10145と比較してより多くの病原性因子を発現していることを確認しています。角膜炎における緑膿菌感染の負担を軽減するための新しい介入戦略。
目的：コンタクトレンズ着用者の感染した角膜と実験室株の感染した角膜から得られた緑膿菌（緑膿菌）の臨床分離株のプロテオームプロファイルを比較する。 方法：標準的な方法を使用して、抗生物質感受性、運動性、バイオフィルム形成、および毒性試験を実施しました。全タンパク質溶解物を3回3回液体クロマトグラフィー/タンデム質量分析（LC-MS/ MS）で分析し、相対タンパク質の存在量をスペクトルカウントで決定しました。統計分析には、統計分析に続くGテストとそれに続く2つの株間のタンパク質の微分発現の有意性を決定するために、統計分析に使用されました。 結果：合計687個のタンパク質が検出されました。133（133）のタンパク質は、2つの株間で有意に異なっていました。これらのうち、13がアップレギュレートされ、16はATCC 10145と比較して臨床株でダウンレギュレートされましたが、57は臨床株でのみ検出されました。上方制御されたタンパク質は、病原性と病原性に関連しています。 結論：緑膿菌の臨床株でより高いレベルで検出されたタンパク質は、毒性因子であることが知られているタンパク質でした。これらの結果は、角膜炎に関連したP. eruginosa株が病原性であり、実験室株ATCC 10145と比較してより多くの病原性因子を発現していることを確認しています。角膜炎における緑膿菌感染の負担を軽減するための新しい介入戦略。
PURPOSE: To compare the proteomic profile of a clinical isolate of Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) obtained from an infected cornea of a contact lens wearer and the laboratory strain P. aeruginosa ATCC 10145. METHODS: Antibiotic sensitivity, motility, biofilm formation, and virulence tests were performed using standard methods. Whole protein lysates were analyzed with liquid chromatography/ tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) in triplicate, and relative protein abundances were determined with spectral counting. The G test followed by a post hoc Holm-Sidak adjustment was used for the statistical analyses to determine significance in the differential expression of proteins between the two strains. RESULTS: A total of 687 proteins were detected. One-hundred thirty-three (133) proteins were significantly different between the two strains. Among these, 13 were upregulated, and 16 were downregulated in the clinical strain compared to ATCC 10145, whereas 57 were detected only in the clinical strain. The upregulated proteins are associated with virulence and pathogenicity. CONCLUSIONS: Proteins detected at higher levels in the clinical strain of P. aeruginosa were proteins known to be virulence factors. These results confirm that the keratitis-associated P. aeruginosa strain is pathogenic and expresses a higher number of virulence factors compared to the laboratory strain ATCC 10145. Identification of the protein profile of the corneal strain of P. aeruginosa in this study will aid in elucidating novel intervention strategies for reducing the burden of P. aeruginosa infection in keratitis.
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