ADAR2は、マウス脳の成熟マイクロRNAのシーケンスと存在量の再現性のある変化を誘導します

RNA（ADAR）に作用するアデノシンデアミナーゼは、miRNA前駆体を含む二本鎖RNAでアデノシンをイノシンに分解します。Aから私への編集は広まっており、通常の生活には必要です。野生型およびADAR2欠損マウス株からの脳miRNAの深いシーケンスデータを比較することにより、編集部位を検出し、高感度でmiRNA処理を変更しました。miRNAで48の新しい編集イベントを検出します。一部の編集イベントは、最大80％の周波数に達します。すべての編集イベントの約半分はADAR2に依存し、一部のmiRNAはADAR1によって優先的に編集されています。すべての編集イベントの64％は、成熟miRNAの種子領域内にあります。高度に編集されたmiR-3099の場合、編集されたmiRNAを新規3 'UTRにリターゲティングすることを実験的に証明します。さらに、miR-497の豊富な編集イベントが、対応するpri-miRNAのDroshaによる処理を促進することを示します。また、隣接するAからI編集イベントから独立して発生するADAR2欠損マウスの特定のmiRNAの豊富さの再現性のある変化を検出します。これは、miRNA前駆体の編集ではなくADAR2結合がそれらの処理に影響を与える可能性があることを示しています。miRNAの存在量の変化と相関すると、ADAR2の存在下または非存在下で、これらのmiRNAの推定ターゲットの誤った規制が見られます。

Adenosine deaminases that act on RNA (ADARs) deaminate adenosines to inosines in double-stranded RNAs including miRNA precursors. A to I editing is widespread and required for normal life. By comparing deep sequencing data of brain miRNAs from wild-type and ADAR2 deficient mouse strains, we detect editing sites and altered miRNA processing at high sensitivity. We detect 48 novel editing events in miRNAs. Some editing events reach frequencies of up to 80%. About half of all editing events depend on ADAR2 while some miRNAs are preferentially edited by ADAR1. Sixty-four percent of all editing events are located within the seed region of mature miRNAs. For the highly edited miR-3099, we experimentally prove retargeting of the edited miRNA to novel 3' UTRs. We show further that an abundant editing event in miR-497 promotes processing by Drosha of the corresponding pri-miRNA. We also detect reproducible changes in the abundance of specific miRNAs in ADAR2-deficient mice that occur independent of adjacent A to I editing events. This indicates that ADAR2 binding but not editing of miRNA precursors may influence their processing. Correlating with changes in miRNA abundance we find misregulation of putative targets of these miRNAs in the presence or absence of ADAR2.