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Spider MiteのサブファミリーTetranychinaeには、多くの農業害虫が含まれています。核リボソームRNA遺伝子の内部転写スペーサー(ITS)領域とミトコンドリアDNAのシトクロムCオキシダーゼサブユニットI(COI)遺伝子は、サブファミリーのテトラニキナエ内の種の同定と系統発生再構成に使用されていますが、常に成功しているわけではありません。。18Sおよび28S RRNA遺伝子は、これらの遺伝子がよりゆっくり進化し、保存された領域と発散ドメインで構成されているため、テトラニキナエの部族や属など、より高いレベルの系統発生を解決するためにより適している必要があります。したがって、18S(1,825-1,901 bp)と28S(646-743 bpの5 '終了)の両方を使用して、Tetranychini族に焦点を当てたサブファミリーTetranychinae内の系統発生関係を推測しました。次に、18Sおよび28S遺伝子の系統樹をミトコンドリアCOI遺伝子(618 bp)の系統と比較しました。以前の研究で観察されたように、COI遺伝子に基づく系統発生は、ツリーのほとんどのノードのブートストラップ値が低いために解決されませんでした。一方、18Sおよび28Sの遺伝子の系統発生ツリーは、サブファミリーのテトランニチナエ内のいくつかの十分にサポートされたクレードを明らかにしました。18Sおよび28Sの系統発生の木は、ブリオビニ族、ペトロビニ、エウリテトラニチーニが単系統であり、部族のテトラニチニが多系統であることを示唆しています。属レベルでは、3種以上がサンプリングされた6つの属が単系統であるように見えますが、4つの属(Oligonychus、Tetranychus、Schizotetranychus、Eotetranychus)は多系統であるように見えます。ここに示されているトポロジーは、現在の形態ベースの分類法に完全には同意していないため、TetranyChinaeの診断的な形態学的特性を再検討する必要があります。
Spider MiteのサブファミリーTetranychinaeには、多くの農業害虫が含まれています。核リボソームRNA遺伝子の内部転写スペーサー(ITS)領域とミトコンドリアDNAのシトクロムCオキシダーゼサブユニットI(COI)遺伝子は、サブファミリーのテトラニキナエ内の種の同定と系統発生再構成に使用されていますが、常に成功しているわけではありません。。18Sおよび28S RRNA遺伝子は、これらの遺伝子がよりゆっくり進化し、保存された領域と発散ドメインで構成されているため、テトラニキナエの部族や属など、より高いレベルの系統発生を解決するためにより適している必要があります。したがって、18S(1,825-1,901 bp)と28S(646-743 bpの5 '終了)の両方を使用して、Tetranychini族に焦点を当てたサブファミリーTetranychinae内の系統発生関係を推測しました。次に、18Sおよび28S遺伝子の系統樹をミトコンドリアCOI遺伝子(618 bp)の系統と比較しました。以前の研究で観察されたように、COI遺伝子に基づく系統発生は、ツリーのほとんどのノードのブートストラップ値が低いために解決されませんでした。一方、18Sおよび28Sの遺伝子の系統発生ツリーは、サブファミリーのテトランニチナエ内のいくつかの十分にサポートされたクレードを明らかにしました。18Sおよび28Sの系統発生の木は、ブリオビニ族、ペトロビニ、エウリテトラニチーニが単系統であり、部族のテトラニチニが多系統であることを示唆しています。属レベルでは、3種以上がサンプリングされた6つの属が単系統であるように見えますが、4つの属(Oligonychus、Tetranychus、Schizotetranychus、Eotetranychus)は多系統であるように見えます。ここに示されているトポロジーは、現在の形態ベースの分類法に完全には同意していないため、TetranyChinaeの診断的な形態学的特性を再検討する必要があります。
The spider mite sub-family Tetranychinae includes many agricultural pests. The internal transcribed spacer (ITS) region of nuclear ribosomal RNA genes and the cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene of mitochondrial DNA have been used for species identification and phylogenetic reconstruction within the sub-family Tetranychinae, although they have not always been successful. The 18S and 28S rRNA genes should be more suitable for resolving higher levels of phylogeny, such as tribes or genera of Tetranychinae because these genes evolve more slowly and are made up of conserved regions and divergent domains. Therefore, we used both the 18S (1,825-1,901 bp) and 28S (the 5' end of 646-743 bp) rRNA genes to infer phylogenetic relationships within the sub-family Tetranychinae with a focus on the tribe Tetranychini. Then, we compared the phylogenetic tree of the 18S and 28S genes with that of the mitochondrial COI gene (618 bp). As observed in previous studies, our phylogeny based on the COI gene was not resolved because of the low bootstrap values for most nodes of the tree. On the other hand, our phylogenetic tree of the 18S and 28S genes revealed several well-supported clades within the sub-family Tetranychinae. The 18S and 28S phylogenetic trees suggest that the tribes Bryobiini, Petrobiini and Eurytetranychini are monophyletic and that the tribe Tetranychini is polyphyletic. At the genus level, six genera for which more than two species were sampled appear to be monophyletic, while four genera (Oligonychus, Tetranychus, Schizotetranychus and Eotetranychus) appear to be polyphyletic. The topology presented here does not fully agree with the current morphology-based taxonomy, so that the diagnostic morphological characters of Tetranychinae need to be reconsidered.
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