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PloS one20140101Vol.9issue(10)

急性呼吸dis迫症候群のプロテオミクスプロファイルは、生存者と非生存者と区別される

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, N.I.H., Extramural
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

急性呼吸困難症候群(ARDS)は、引き続き高い死亡率を持っています。現在、臨床試験参加者の間で臨床管理や層状のリスクを導くための信頼できる予後情報を提供するバイオマーカーはありません。この研究の目的は、気管支肺胞洗浄液(BALF)プロテオームを調べて、生存者をARDSの非生存者と区別するタンパク質を特定することでした。患者は、ARDSの機械的換気の開始後の時間に基づいて、早期(1〜7日)および後期(8〜35日)のグループに分けられました(1日目)。LC MS/MSを使用した絶対および相対定量(ITRAQ)の等変量タグは、初期の生存者(n = 7)、初期段階の非生存者(n = 8)からの中程度および低存在性タンパク質のために濃縮されたプールされたBALFで実行されました(n = 8)、後期生存者(n = 7)。グローバルな誤検出率1%で特定された724個のタンパク質のうち、499で定量的情報が利用可能でした。初期相ARDSでは、傷害とストレスに対する協調的な代償反応を示すオントロジーにマッピングされた生存者でより豊富に豊富になりました。これらには、凝固と線維分解が含まれていました。免疫システムの活性化;陽イオンと鉄の恒常性。初期相の非生存者でより豊富なタンパク質は、代償反応の活性化はなく、炭水化物の異化とコラーゲン合成に関与しています。初期相の生存者に見られる代償性免疫活性化およびイオン恒常性反応は、後期の生存者の細胞移動およびアクチンフィラメントベースのプロセスに移行し、肺が治癒するにつれてBALFプロテオームの動的な変化を明らかにしました。生存者を非生存者と区別する初期のタンパク質は、ARDSの生存を予測するための候補バイオマーカーです。

急性呼吸困難症候群(ARDS)は、引き続き高い死亡率を持っています。現在、臨床試験参加者の間で臨床管理や層状のリスクを導くための信頼できる予後情報を提供するバイオマーカーはありません。この研究の目的は、気管支肺胞洗浄液(BALF)プロテオームを調べて、生存者をARDSの非生存者と区別するタンパク質を特定することでした。患者は、ARDSの機械的換気の開始後の時間に基づいて、早期(1〜7日)および後期(8〜35日)のグループに分けられました(1日目)。LC MS/MSを使用した絶対および相対定量(ITRAQ)の等変量タグは、初期の生存者(n = 7)、初期段階の非生存者(n = 8)からの中程度および低存在性タンパク質のために濃縮されたプールされたBALFで実行されました(n = 8)、後期生存者(n = 7)。グローバルな誤検出率1%で特定された724個のタンパク質のうち、499で定量的情報が利用可能でした。初期相ARDSでは、傷害とストレスに対する協調的な代償反応を示すオントロジーにマッピングされた生存者でより豊富に豊富になりました。これらには、凝固と線維分解が含まれていました。免疫システムの活性化;陽イオンと鉄の恒常性。初期相の非生存者でより豊富なタンパク質は、代償反応の活性化はなく、炭水化物の異化とコラーゲン合成に関与しています。初期相の生存者に見られる代償性免疫活性化およびイオン恒常性反応は、後期の生存者の細胞移動およびアクチンフィラメントベースのプロセスに移行し、肺が治癒するにつれてBALFプロテオームの動的な変化を明らかにしました。生存者を非生存者と区別する初期のタンパク質は、ARDSの生存を予測するための候補バイオマーカーです。

Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS) continues to have a high mortality. Currently, there are no biomarkers that provide reliable prognostic information to guide clinical management or stratify risk among clinical trial participants. The objective of this study was to probe the bronchoalveolar lavage fluid (BALF) proteome to identify proteins that differentiate survivors from non-survivors of ARDS. Patients were divided into early-phase (1 to 7 days) and late-phase (8 to 35 days) groups based on time after initiation of mechanical ventilation for ARDS (Day 1). Isobaric tags for absolute and relative quantitation (iTRAQ) with LC MS/MS was performed on pooled BALF enriched for medium and low abundance proteins from early-phase survivors (n = 7), early-phase non-survivors (n = 8), and late-phase survivors (n = 7). Of the 724 proteins identified at a global false discovery rate of 1%, quantitative information was available for 499. In early-phase ARDS, proteins more abundant in survivors mapped to ontologies indicating a coordinated compensatory response to injury and stress. These included coagulation and fibrinolysis; immune system activation; and cation and iron homeostasis. Proteins more abundant in early-phase non-survivors participate in carbohydrate catabolism and collagen synthesis, with no activation of compensatory responses. The compensatory immune activation and ion homeostatic response seen in early-phase survivors transitioned to cell migration and actin filament based processes in late-phase survivors, revealing dynamic changes in the BALF proteome as the lung heals. Early phase proteins differentiating survivors from non-survivors are candidate biomarkers for predicting survival in ARDS.

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