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目的：ロタウイルスワクチンを導入する前にパキスタンで重度の急性水様性下痢で入院した小児のロタウイルス胃腸炎の負担と分子疫学を決定する。 方法：2006年から2008年のカラチ、ラホール、ラワルピンディ、ペシャワールの都市の5つのセンチネル病院で、2006年から2008年にかけて断面研究が実施されました。重度の急性水様性下痢で入院した5歳未満の小児から収集された便サンプルは、酵素免疫測定法（EIA）を介してロタウイルス抗原についてテストされました（IDEA REF K6020 Oxoid Ltd（ELY）、ケンブリッジ、英国）。EIA陽性便サンプルのサブセットは、ジェノタイピングのためにさらに処理されました。 結果：6679人の子供が登録され、2039人（30.5％）の便標本がロタウイルスに対して陽性でした。ロタウイルスの陽性は、ラホールで最も陽性の5つの病院で16.3％から39.4％の範囲でした。すべてのロタウイルス症例の1241（61％）は、1歳未満の乳児でした。G溶性型について調べた株の中で、G1、G2、G9、およびG4株の発生は、それぞれ28％、24％、14％、および13％であることがわかりました。Pタイプの中で、最も一般的に発生する株はp6（31.5％）に続いてp8（20％）とp4（12％）でした。重度の下痢の入院小児における一般的なロタウイルス遺伝子型はG1P [8] 11.6％（69/593）であり、その後G2P [4] 10.4％（62/593）、およびG4P [6] 10.1％（60/593）が続きました。 結論：パキスタンの都市センターで重度の胃腸炎で入院した子供の約3分の1はロタウイルスを持っています。パキスタンの国家予防接種プログラムにおけるロタウイルスワクチンの導入は、多くの深刻なエピソードや下痢の死を防ぐことができます。
目的：ロタウイルスワクチンを導入する前にパキスタンで重度の急性水様性下痢で入院した小児のロタウイルス胃腸炎の負担と分子疫学を決定する。 方法：2006年から2008年のカラチ、ラホール、ラワルピンディ、ペシャワールの都市の5つのセンチネル病院で、2006年から2008年にかけて断面研究が実施されました。重度の急性水様性下痢で入院した5歳未満の小児から収集された便サンプルは、酵素免疫測定法（EIA）を介してロタウイルス抗原についてテストされました（IDEA REF K6020 Oxoid Ltd（ELY）、ケンブリッジ、英国）。EIA陽性便サンプルのサブセットは、ジェノタイピングのためにさらに処理されました。 結果：6679人の子供が登録され、2039人（30.5％）の便標本がロタウイルスに対して陽性でした。ロタウイルスの陽性は、ラホールで最も陽性の5つの病院で16.3％から39.4％の範囲でした。すべてのロタウイルス症例の1241（61％）は、1歳未満の乳児でした。G溶性型について調べた株の中で、G1、G2、G9、およびG4株の発生は、それぞれ28％、24％、14％、および13％であることがわかりました。Pタイプの中で、最も一般的に発生する株はp6（31.5％）に続いてp8（20％）とp4（12％）でした。重度の下痢の入院小児における一般的なロタウイルス遺伝子型はG1P [8] 11.6％（69/593）であり、その後G2P [4] 10.4％（62/593）、およびG4P [6] 10.1％（60/593）が続きました。 結論：パキスタンの都市センターで重度の胃腸炎で入院した子供の約3分の1はロタウイルスを持っています。パキスタンの国家予防接種プログラムにおけるロタウイルスワクチンの導入は、多くの深刻なエピソードや下痢の死を防ぐことができます。
OBJECTIVES: To determine the burden and molecular epidemiology of rotavirus gastroenteritis in children hospitalized with severe acute watery diarrhea in Pakistan prior to introduction of rotavirus vaccine. METHODS: A cross-sectional study was carried out over a period of two years from 2006 - 2008 at five sentinel hospitals in the cities of Karachi, Lahore, Rawalpindi, and Peshawar. Stool samples collected from children under five years of age hospitalized with severe acute watery diarrhea were tested for rotavirus antigen via enzyme immunoassay (EIA) (IDEA REF K6020 Oxoid Ltd (Ely), Cambridge, United Kingdom). A subset of EIA positive stool samples were further processed for genotyping. RESULTS: 6679 children were enrolled and stool specimens of 2039 (30.5%) were positive for rotavirus. Rotavirus positivity ranged from 16.3% to 39.4% in the 5 hospitals with highest positivity in Lahore. 1241 (61%) of all rotavirus cases were in infants under one year of age. Among the strains examined for G-serotypes, the occurrence of G1, G2, G9 and G4 strains was found to be 28%, 24%, 14% and 13%, respectively. Among P-types, the most commonly occurring strains were P6 (31.5%) followed by P8 (20%) and P4 (12%). Prevalent rotavirus genotype in hospitalized children of severe diarrhea were G1P[8] 11.6% (69/593), followed by G2P[4] 10.4% (62/593), and G4P[6] 10.1% (60/593). CONCLUSIONS: Approximately one third of children hospitalized with severe gastroenteritis in urban centers in Pakistan have rotavirus. Introduction of rotavirus vaccine in Pakistan's national immunization program could prevent many severe episodes and diarrheal deaths.
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