ヒトU1のRNA結合セグメントの同定Aタンパク質とU1 SnRNA上のその結合部位の定義

U1 SNRNP特異的U1 Aタンパク質とU1 SnRNAの相互作用が分析されています。RNA上のタンパク質の結合部位は、RNAの位置48から91まで伸びるヘアピンIIであることが示されています。このヘアピン内で、進化的に保存されたループシーケンスは、U1 Aタンパク質との相互作用に不可欠です。U1タンパク質は、安定したヘアピン構造を形成できない人工RNAの一部である場合、ループ配列に結合することもできます。U1 SnRNAに結合するために必要なタンパク質の領域は、多くのリボ核タンパク質（RNP）タンパク質で以前に同定された保存された80アミノ酸モチーフで構成され、（最大）11 N末端および10 C末端隣接アミノ酸とともに。このモチーフの最も高度に保存された2つの領域に導入された点変異は、RNA結合を廃止します。U1結合部位が削除されたU1 SnRNA変異体は、U1 Aタンパク質を認識する患者の抗血清によって免疫沈降するRNP粒子に組み立てることができることが示されています。U SNRNPアセンブリにおけるRNAタンパク質とタンパク質間相互作用の役割について説明します。

The interaction between the U1 snRNP-specific U1 A protein and U1 snRNA has been analysed. The binding site for the protein on the RNA is shown to be in hairpin II, which extends from positions 48 to 91 in the RNA. Within this hairpin the evolutionarily conserved loop sequence is crucial for interaction with U1 A protein. U1 A protein can also bind the loop sequence when it is part of an artificial RNA which cannot form a stable hairpin structure. The region of the protein required to bind to U1 snRNA consists of a conserved 80 amino acid motif, previously identified in many ribonucleoprotein (RNP) proteins, together with (maximally) 11 N-terminal and 10 C-terminal flanking amino acids. Point mutations introduced into two of the most highly conserved regions of this motif abolish RNA binding. U1 snRNA mutants from which the U1 A binding site has been deleted are shown to be capable of assembly into RNP particles which are immunoprecipitable by patient antisera which recognize U1 A protein. The role of RNA-protein and protein-protein interactions in U snRNP assembly are discussed.