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コンテキスト:ホルマリン固定とパラフィン埋め込みは、病理と病理と前解体の両方の手渡しの両方を表す、ホルマリン固定のパラフィン埋め込まれたブロックの実質的な貯留層をもたらした、ヒト組織の生物球菌を保存する時代を超越した、費用効率が高く、広く採用された方法です。バイオセキメン。この標本の貯水池は、DNA、RNA、およびプロテオーム解析にますます使用されています。 目的:下流の形態学的および分子エンドポイントに対するホルマリン固定およびパラフィン埋め込みプロセスに関連する前分裂因子の影響を評価する。 データソース:DNA、RNA、タンパク質、および形態学的エンドポイントに対するホルマリン固定およびパラフィン埋め込みプロセスに関連する前分析因子の潜在的な影響を調査する公開されたレポートのために、国立がん研究所のバイセキメン研究データベースを使用して既存の文献を調査しました。 結論:文献の証拠に基づいて、分子、プロテオーム、および形態学的エンドポイントは、最適でない処理条件によってホルマリン固定のパラフィン包埋標本で変更できます。特定の前解体因子に関連する効果の方向と大きさは、分析物(DNA、RNA、タンパク質、形態)および分析プラットフォームに依存していましたが、許容可能な条件が強調され、分析を妨げる可能性のある条件の要約が強調されています。
コンテキスト:ホルマリン固定とパラフィン埋め込みは、病理と病理と前解体の両方の手渡しの両方を表す、ホルマリン固定のパラフィン埋め込まれたブロックの実質的な貯留層をもたらした、ヒト組織の生物球菌を保存する時代を超越した、費用効率が高く、広く採用された方法です。バイオセキメン。この標本の貯水池は、DNA、RNA、およびプロテオーム解析にますます使用されています。 目的:下流の形態学的および分子エンドポイントに対するホルマリン固定およびパラフィン埋め込みプロセスに関連する前分裂因子の影響を評価する。 データソース:DNA、RNA、タンパク質、および形態学的エンドポイントに対するホルマリン固定およびパラフィン埋め込みプロセスに関連する前分析因子の潜在的な影響を調査する公開されたレポートのために、国立がん研究所のバイセキメン研究データベースを使用して既存の文献を調査しました。 結論:文献の証拠に基づいて、分子、プロテオーム、および形態学的エンドポイントは、最適でない処理条件によってホルマリン固定のパラフィン包埋標本で変更できます。特定の前解体因子に関連する効果の方向と大きさは、分析物(DNA、RNA、タンパク質、形態)および分析プラットフォームに依存していましたが、許容可能な条件が強調され、分析を妨げる可能性のある条件の要約が強調されています。
CONTEXT: Formalin fixation and paraffin embedding is a timeless, cost-efficient, and widely adopted method of preserving human tissue biospecimens that has resulted in a substantial reservoir of formalin-fixed, paraffin-embedded blocks that represent both the pathology and preanalytical handling of the biospecimen. This reservoir of specimens is increasingly being used for DNA, RNA, and proteomic analyses. OBJECTIVE: To evaluate the impact of preanalytical factors associated with the formalin fixation and paraffin embedding process on downstream morphological and molecular endpoints. DATA SOURCES: We surveyed the existing literature using the National Cancer Institute's Biospecimen Research Database for published reports investigating the potential influence of preanalytical factors associated with the formalin fixation and paraffin embedding process on DNA, RNA, protein, and morphological endpoints. CONCLUSIONS: Based on the literature evidence, the molecular, proteomic, and morphological endpoints can be altered in formalin-fixed, paraffin-embedded specimens by suboptimal processing conditions. While the direction and magnitude of effects associated with a given preanalytical factor were dependent on the analyte (DNA, RNA, protein, and morphology) and analytical platform, acceptable conditions are highlighted, and a summary of conditions that could preclude analysis is provided.
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