インフルエンザA HAサブタイプの推奨される番号付けスキーム

インフルエンザウイルスのサブタイプ間の残基の比較は、循環株の人獣共通感染潜在物を評価し、サブタイプ間の比較研究のためにますます使用されています。インフルエンザAヘマグルチニン（HA）配列の13のサブタイプのN末端切断部位の分析は、以前に星と同僚によって説明されています。インフルエンザの18の既知のサブタイプのこの分析を拡張しました。HAの長さの違いにより、H1とH5の複数のクレードからの株、および高病原性と低病原性の両方のH5およびH7サブタイプの株を含めました。インフルエンザA HAの既知の構造の分析により、成熟したHAシーケンスに基づいたナンつシステムを使用して、すべてのHAサブタイプで構造的および機能的に同等のアミノ酸を定義することができます。ウイルスの表現型に影響を与えることが知られているアミノ酸の同等のリストを提供します。

Comparisons of residues between sub-types of influenza virus is increasingly used to assess the zoonotic potential of a circulating strain and for comparative studies across subtypes. An analysis of N-terminal cleavage sites for thirteen subtypes of influenza A hemagglutinin (HA) sequences, has previously been described by Nobusawa and colleagues. We have expanded this analysis for the eighteen known subtypes of influenza. Due to differences in the length of HA, we have included strains from multiple clades of H1 and H5, as well as strains of H5 and H7 subtypes with both high and low pathogenicity. Analysis of known structures of influenza A HA enables us to define amino acids which are structurally and functionally equivalent across all HA subtypes using a numbering system based on the mature HA sequence. We provide a list of equivalences for amino acids which are known to affect the phenotype of the virus.