ラブドイド分化による腎細胞癌の遺伝的変化

成人患者におけるラブドイド分化（RCC-R）を伴う腎細胞癌は、特定の遺伝的変化が知られていない腎癌の攻撃的な変異体です。この研究の目的は、高密度の単一ヌクレオチド多型（SNP）アレイを利用することにより、RCC-Rのゲノム全体の遺伝的異常を特徴付けることでした。RCC-Rの20例を特定しました。これは、透明な細胞腎細胞癌とラブドイドの組織形態学的成分の両方を示しました。DNAは、ホルマリン固定のパラフィン包埋組織（各症例からの透明細胞腎細胞癌およびRCC-R領域から）から抽出され、高密度SNPアレイアッセイを受けました。症例の10％に存在する遺伝的異常は有意とみなされました。透明な細胞組織形態のある領域では、染色体5Q（66.7％、10/15）、7（46.7％、7/15）、および8Q（46.7％、7/15）で最も一般的に観察されました。染色体14（60％、9/15）、8p（46.7％、7/15）、および22（46.7％、7/15）で損失が最も一般的に特定されました。ラブドイド分化がある領域では、染色体7で最も一般的に観察されました（58.8％、10/17）。染色体9（70.6％、12/17）、14（58.8％、10/17）、4（52.9％、9/17）、および17P（52.9％、9/17）で損失が最も一般的に特定されました。ラブドイド細胞は多くの染色体異常を共有し、共存する透明細胞と比較して、より多くのコピー数の変動を示しました。11pの損失はラブドイド分化に特異的であり、透明な細胞領域の0％と比較して、ラブドイド成分の29.4％で損失が見られました。ラブドイド細胞の全体的な遺伝的変化の数が多く、ラブドイドと透明な細胞領域の間の共有遺伝的背景は、組織形態学的進行と相関するラブドイド細胞の遺伝的進化を示唆しています。

Renal cell carcinoma with rhabdoid differentiation (RCC-R) in adult patients is an aggressive variant of renal cancer with no known specific genetic alterations. The aim of this study was to characterize genome-wide genetic aberrations in RCC-R via utilization of high-density single-nucleotide polymorphism (SNP) arrays. We identified 20 cases of RCC-R, which displayed both clear cell renal cell carcinoma and rhabdoid histomorphologic components. DNA was extracted from formalin-fixed, paraffin-embedded tissue (from clear cell renal cell carcinoma and RCC-R areas from each case) and subjected to high-density SNP array assay. Genetic aberrations present in 10% of cases were considered significant. In areas with clear cell histomorphology, gains were most commonly observed in chromosomes 5q (66.7%, 10/15), 7 (46.7%, 7/15), and 8q (46.7%, 7/15); and losses were most commonly identified in chromosomes 14 (60%, 9/15), 8p (46.7%, 7/15), and 22 (46.7%, 7/15). In areas with rhabdoid differentiation, gains were most commonly observed in chromosome 7 (58.8%, 10/17); and losses were most commonly identified in chromosomes 9 (70.6%, 12/17), 14 (58.8%, 10/17), 4 (52.9%, 9/17), and 17p (52.9%, 9/17). Rhabdoid cells shared many chromosomal abnormalities and exhibited a greater number of copy number variations in comparison with coexisting clear cells. Loss of 11p was specific for rhabdoid differentiation, with loss found in 29.4% of rhabdoid components compared with 0% of clear cell areas. The greater number of overall genetic alterations in the rhabdoid cells and the shared genetic background between rhabdoid and clear cell areas suggest genetic evolution of the rhabdoid cells that correlates with histomorphologic progression.