ArchaeaとThe Human Gut：古い物語の新たな始まり

メタン生成古細菌は、30年以上前にメタノバクテリア科、メタノブレビバクターSmithii、およびメタノファーラスタットマネーに属する2つのメタン生成種の分離を通じて、30年以上前から人間の腸の住民として知られています。過去10年間、人間の胃腸管（GIT）で遭遇した古細菌の多様性は、新しい株のシーケンスの識別と培養によって拡張されました。ここでは、人間のGITに関連する古細菌の多様性の最新の国勢調査と、腸の生理学と健康におけるそれらの可能な役割を提供します。特に、高齢者に関連するメタノマシリコッカスであるメタノジェンの7日目のまだ不十分に特徴付けられていることに焦点を当てています。また、主に非GIT環境に分布していますが、この新規メタン剤の順序に関する実際の知識は、主にGITの住民を通じて明らかにされています。彼らは、腸の代謝産物の最終電子受容体の数をモノ・ディ・ディ・ディエチルアミンとトリメチルアミンに拡大します。トリメチルアミンは、正常な食事からの栄養素（レシチン、コリン、TMAO、L-カルニチン）の微生物叢由来生成物のみであり、そこから2つの疾患、トリメチルアミン尿（または魚風症候群）とその酸化酸化特性の植物生成特性を介した心血管疾患を発生するようです。肝臓由来の形。したがって、これは、これらのメタン生成種への関心と、古細菌由来のプロバイオティクスの概念から造られた用語である考古学としての使用をサポートしています。

Methanogenic archaea are known as human gut inhabitants since more than 30 years ago through the detection of methane in the breath and isolation of two methanogenic species belonging to the order Methanobacteriales, Methanobrevibacter smithii and Methanosphaera stadtmanae. During the last decade, diversity of archaea encountered in the human gastrointestinal tract (GIT) has been extended by sequence identification and culturing of new strains. Here we provide an updated census of the archaeal diversity associated with the human GIT and their possible role in the gut physiology and health. We particularly focus on the still poorly characterized 7th order of methanogens, the Methanomassiliicoccales, associated to aged population. While also largely distributed in non-GIT environments, our actual knowledge on this novel order of methanogens has been mainly revealed through GIT inhabitants. They enlarge the number of final electron acceptors of the gut metabolites to mono- di- and trimethylamine. Trimethylamine is exclusively a microbiota-derived product of nutrients (lecithin, choline, TMAO, L-carnitine) from normal diet, from which seems originate two diseases, trimethylaminuria (or Fish-Odor Syndrome) and cardiovascular disease through the proatherogenic property of its oxidized liver-derived form. This therefore supports interest on these methanogenic species and its use as archaebiotics, a term coined from the notion of archaea-derived probiotics.