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Genetika2013Oct01Vol.49issue(10)

[景観と生態学的ゲノミクス]

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文献タイプ:
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概要
Abstract

ランドスケープゲノミクスは、人口遺伝学、景観生態学、空間統計の組み合わせとして約10年前に発生した規律であるランドスケープ遺伝学の現代バージョンです。それは、遺伝的なつながりと集団の変動を決定する遺伝子の流れやその他の微小進化プロセスに対する環境変数の影響を研究しています。人口遺伝学とは対照的に、それは人口サンプルのレベルではなく、個々の標本のレベルで動作します。景観遺伝学とゲノミクスと集団遺伝学のもう1つの重要な違いは、前者では、遺伝子の流れと局所適応の分析が、マトリックスの地形と特徴、つまり種の生息地を分離する敵対的な空間を定量的に説明することです。景観ゲノミクスは人口のエコゲノミクスの一部であり、コミュニティのゲノミクスとともに、生態学的ゲノミクスの主要な部分です。景観ゲノミクスの主な目的の1つは、さまざまなゲノム全体および軌跡特異的効果の同定と分化です。ゲノムと景観変数の組み合わせ分析のために開発されたアプローチと計算ツールは、環境の予想される変化に応じて保存努力の計画と種の運命の予測を促進する適応関連のゲノム断片を検出することを可能にします。

ランドスケープゲノミクスは、人口遺伝学、景観生態学、空間統計の組み合わせとして約10年前に発生した規律であるランドスケープ遺伝学の現代バージョンです。それは、遺伝的なつながりと集団の変動を決定する遺伝子の流れやその他の微小進化プロセスに対する環境変数の影響を研究しています。人口遺伝学とは対照的に、それは人口サンプルのレベルではなく、個々の標本のレベルで動作します。景観遺伝学とゲノミクスと集団遺伝学のもう1つの重要な違いは、前者では、遺伝子の流れと局所適応の分析が、マトリックスの地形と特徴、つまり種の生息地を分離する敵対的な空間を定量的に説明することです。景観ゲノミクスは人口のエコゲノミクスの一部であり、コミュニティのゲノミクスとともに、生態学的ゲノミクスの主要な部分です。景観ゲノミクスの主な目的の1つは、さまざまなゲノム全体および軌跡特異的効果の同定と分化です。ゲノムと景観変数の組み合わせ分析のために開発されたアプローチと計算ツールは、環境の予想される変化に応じて保存努力の計画と種の運命の予測を促進する適応関連のゲノム断片を検出することを可能にします。

Landscape genomics is the modern version of landscape genetics, a discipline that arose approximately 10 years ago as a combination of population genetics, landscape ecology, and spatial statistics. It studies the effects of environmental variables on gene flow and other microevolutionary processes that determine genetic connectivity and variations in populations. In contrast to population genetics, it operates at the level of individual specimens rather than at the level of population samples. Another important difference between landscape genetics and genomics and population genetics is that, in the former, the analysis of gene flow and local adaptations takes quantitative account of landforms and features of the matrix, i.e., hostile spaces that separate species habitats. Landscape genomics is a part of population ecogenomics, which, along with community genomics, is a major part of ecological genomics. One of the principal purposes of landscape genomics is the identification and differentiation of various genome-wide and locus-specific effects. The approaches and computation tools developed for combined analysis of genomic and landscape variables make it possible to detect adaptation-related genome fragments, which facilitates the planning of conservation efforts and the prediction of species' fate in response to expected changes in the environment.

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