南米地域で流行しているパンデミックH1N1型インフルエンザAウイルスのノイラミニダーゼ遺伝子の系統解析

世界のすべての地域で流行しているインフルエンザ A ウイルス (IAV) の分子的特徴付けは、毒性の増加、抗ウイルス耐性、免疫逃避に潜在的に関与する変異を検出するために不可欠です。これらの問題についての洞察を得るために、2009年から2013年にアルゼンチン、ブラジル、チリ、パラグアイ、ペルー、ウルグアイで分離された146のパンデミックH1N1（H1N1pdm）A型インフルエンザウイルス株のノイラミニダーゼ（NA）遺伝子の系統解析が行われた。2010年から2013年のインフルエンザシーズンに南半球に推奨されたインフルエンザワクチンに含まれていたワクチン株A/California/7/2009と南米で分離された株を比較すると、いくつかのアミノ酸置換が明らかになった。これらの置換のマッピングにより、そのほとんどがタンパク質の表面に位置し、活性部位を妨げないことが明らかになりました。これらの研究に登録された株の 3.4% は、オセルタミビルに対する耐性を与える H275Y 置換を保有していました。南アメリカで分離された菌株は、NA タンパク質の 102 ～ 103 位と 351 ～ 352 位に存在すると予測される 2 つの B 細胞エピトープ領域においてワクチンとは異なります。さらに、パラグアイで単離されたワクチンと株は、229 位に存在するエピトープも異なります。南米で単離された株とワクチン株の間のこれらの違いは、これらのエピトープがこの地域で単離された株には存在しない可能性を示唆しています。ブラジルで分離された H1N1pdm IAV 株の NA タンパク質で、潜在的な新しい N 結合型グリコシル化部位が観察されました。これらの研究の結果、南米で流通しているワクチンと株の間で、H1N1pdm IAV の NA におけるいくつかの遺伝的および抗原的な違いが明らかになりました。これらの発見はすべて、南米地域で流行している H1N1pdm IAV 集団の遺伝的および抗原進化の過程の理解に貢献し、その結果、将来のより適切なワクチンおよび抗ウイルス薬の研究と選択に貢献します。

Molecular characterization of circulating influenza A viruses (IAV) in all regions of the world is essential to detect mutations potentially involved in increased virulence, anti-viral resistance and immune escape. In order to gain insight into these matters, a phylogenetic analysis of the neuraminidase (NA) gene of 146 pandemic H1N1 (H1N1pdm) influenza A virus strains isolated in Argentina, Brazil, Chile, Paraguay, Peru and Uruguay from 2009 to 2013 was performed. Comparison of vaccine strain A/California/7/2009 included in the influenza vaccine recommended for the Southern hemisphere from 2010 through 2013 influenza seasons and strains isolated in South America revealed several amino acid substitutions. Mapping of these substitutions revealed that most of them are located at the surface of the protein and do not interfere with the active site. 3.4% of the strains enrolled in these studies carried the H275Y substitution that confers resistance to oseltamivir. Strains isolated in South America differ from vaccine in two predicted B-cell epitope regions present at positions 102-103 and 351-352 of the NA protein. Moreover, vaccine and strains isolated in Paraguay differ also in an epitope present at position 229. These differences among strains isolated in South America and vaccine strain suggests that these epitopes may not be present in strains isolated in this region. A potential new N-linked glycosylation site was observed in the NA protein of an H1N1pdm IAV strain isolated in Brazil. The results of these studies revealed several genetic and antigenic differences in the NA of H1N1pdm IAV among vaccine and strains circulating in South America. All these findings contribute to our understanding of the course of genetic and antigenic evolution of H1N1pdm IAV populations circulating in the South American region and, consequently, contribute to the study and selection of future and more appropriate vaccines and anti-viral drugs.