癌凍結組織の免疫染色のためにDNAアプタマープローブを使用する

組織免疫染色は臨床応用で非常に重要であり、抗体は分子プローブとして広範囲に使用されています。最近、Aptamerは、新しいクラスのプローブとして、潜在的な臨床的および研究価値に多くの注目を集めています。上皮細胞接着分子（EPCAM）は、上皮起源の多くの癌で過剰発現する特定のバイオマーカーです。ここでは、DNAベースのEPCAMアプタマーSYL3Cが、結腸直腸癌組織の凍結およびパラフィン包埋セクションの免疫染色のプローブとして報告されています。商業化されたEPCAM抗体も標準制御として使用されました。EPCAMアプタマーSYL3Cは、結腸直腸腫瘍切片の癌の巣を具体的に認識および免疫染色しましたが、腫瘍部位内のバックグラウンド細胞とは反応せず、結腸直腸組織の良性病変や炎症に対する交差反応を示しませんでした。EPCAM陰性の悪性腫瘍切片との架橋は発生しませんでした。標準的な抗体染色と比較して、EPCAMアプタマーSYL3Cプロトコルは、より短い反応時間で実装する方が簡単です。さらに、SYL3Cは、冷凍またはパラフィン包埋組織切片のいずれかで特異的に結合できます。凍結組織の組織病理学は新鮮な組織の組織病理学に近く、凍結切片をパラフィン包埋された切片よりも迅速に生成できるため、凍結切片のsyl3c免疫染色は簡単に実装できます。

Tissue immunostaining is critically important in clinical applications, and antibodies have been used extensively as the molecular probes. Recently, aptamer, as a new class of probes, have attracted much attention for their potential clinical and research value. Epithelial cell adhesion molecule (EpCAM) is a specific biomarker which is overexpressed in many cancers of epithelial origin. Here, a DNA-based EpCAM aptamer SYL3C is reported as a probe for the immunostaining of frozen and paraffin-embedded sections of colorectal cancer tissues. Commercialized EpCAM antibodies were also used as a standard control. EpCAM aptamer SYL3C specifically recognized and immunostained cancer nests of colorectal tumor sections, but it neither reacted with background cells within tumor sites nor exhibited cross-reaction to the benign lesions or inflammation of colorectal tissues. No cross-linking to EpCAM-negative malignant tumor sections occurred. Compared with standard antibody staining, our EpCAM aptamer SYL3C protocol is simpler to implement with a shorter reaction time. Moreover, SYL3C can specifically bind with either frozen or paraffin-embedded tissue sections. Since the histopathology of frozen tissue is closer to that of fresh tissue and since frozen sections can be produced more quickly than paraffin-embedded sections, SYL3C immunostaining of frozen sections is a quick protocol that is easy to implement.