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O6-メチルグアニンDNAメチルトランスフェラーゼ（MGMT）遺伝子プロモーターの高メチル化は、グリオブラストマス腫における全生存率（OS）および無増悪生存率（PFS）の観点から、テモゾロミド治療と好ましい結果に対する反応の予測バイオマーカーであることはすでによく知られています。（GBM）患者。それにもかかわらず、理想的な技術と組織サンプル標本の選択は依然として議論の余地があるため、MGMTメチル化状態は現在、日常的な臨床診療に導入されていません。この研究の目的は、2つの分析方法、メチル化特異的ポリメラーゼ連鎖反応（MSP）と鳴き声（PSQ）を比較することでした。、46 GBM患者の単一中心で均一に治療されたコホートから入手しました。すべての凍結組織からメチル化データを取得しましたが、5つのFFPEサンプルでは結果は得られませんでした。メチル化の最高の一致は、PSQ（76.7％、23/30サンプル）を使用して、凍結組織（88.5％、23/26サンプル）で見つかりました。さらに、MGMTプロモーターのメチル化を担当する患者のOSおよびPFSは、メチル化されていないプロモーターの患者よりも長いことを確認しました。結論として、我々は、偽陽性の結果のリスクが高いため、MSPはFFPE組織の限られた手法であると考えました。対照的に、私たちのデータは、PSQが、高感度と特異性を備えた定量的結果に到達できるため、メチル化/メチル化されていない患者を層別化する最も強力な方法であることを示しています。さらに、腫瘍全体のメチル化におけるDNA分解と均一性が低いため、凍結腫瘍組織がMGMTメチル化分析に最適な標本であることが示されました。
O6-メチルグアニンDNAメチルトランスフェラーゼ（MGMT）遺伝子プロモーターの高メチル化は、グリオブラストマス腫における全生存率（OS）および無増悪生存率（PFS）の観点から、テモゾロミド治療と好ましい結果に対する反応の予測バイオマーカーであることはすでによく知られています。（GBM）患者。それにもかかわらず、理想的な技術と組織サンプル標本の選択は依然として議論の余地があるため、MGMTメチル化状態は現在、日常的な臨床診療に導入されていません。この研究の目的は、2つの分析方法、メチル化特異的ポリメラーゼ連鎖反応（MSP）と鳴き声（PSQ）を比較することでした。、46 GBM患者の単一中心で均一に治療されたコホートから入手しました。すべての凍結組織からメチル化データを取得しましたが、5つのFFPEサンプルでは結果は得られませんでした。メチル化の最高の一致は、PSQ（76.7％、23/30サンプル）を使用して、凍結組織（88.5％、23/26サンプル）で見つかりました。さらに、MGMTプロモーターのメチル化を担当する患者のOSおよびPFSは、メチル化されていないプロモーターの患者よりも長いことを確認しました。結論として、我々は、偽陽性の結果のリスクが高いため、MSPはFFPE組織の限られた手法であると考えました。対照的に、私たちのデータは、PSQが、高感度と特異性を備えた定量的結果に到達できるため、メチル化/メチル化されていない患者を層別化する最も強力な方法であることを示しています。さらに、腫瘍全体のメチル化におけるDNA分解と均一性が低いため、凍結腫瘍組織がMGMTメチル化分析に最適な標本であることが示されました。
It is already well known that hypermethylation of the O6-methylguanine DNA methyltransferase (MGMT) gene promoter is a predictive biomarker of response to temozolomide treatment and of favorable outcomes in terms of overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) in glioblastoma (GBM) patients. Nevertheless, MGMT methylation status has not currently been introduced into routine clinical practice, as the choice of the ideal technique and tissue sample specimen is still controversial. The aim of this study was to compare 2 analytical methods, methylation-specific polymerase chain reaction (MSP) and pyrosequencing (PSQ), and their use on 2 different tissue type samples, snap-frozen and formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE), obtained from a single-center and uniformly treated cohort of 46 GBM patients. We obtained methylation data from all frozen tissues, while no results were obtained for 5 FFPE samples. The highest concordance for methylation was found on frozen tissues (88.5%, 23/26 samples), using PSQ (76.7%, 23/30 samples). Moreover, we confirmed that OS and PFS for patients carrying methylation of the MGMT promoter were longer than for patients with an unmethylated promoter. In conclusion, we considered MSP a limited technique for FFPE tissues due to the high risk of false-positive results; in contrast, our data indicated PSQ as the most powerful method to stratify methylated/unmethylated patients as it allows reaching quantitative results with high sensitivity and specificity. Furthermore, frozen tumor tissues were shown to be the best specimens for MGMT methylation analysis, due to the low DNA degradation and homogeneity in methylation throughout the tumor.
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