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一般的にウイルスによって引き起こされる急性呼吸器感染症は、小児の罹患率と死亡率の重要な原因です。アルゼンチンでは、呼吸器ウイルスの検出に関する国家監視プログラムは、通常、免疫蛍光(IF)アッセイを使用して実行されますが、分子法はより敏感であることがよく知られています。自動化されたマルチプレックスPCRデバイスであるFilmArray-Respiratoryパネル(FilmArray-RP)は、閉じたシステムで17のウイルス性病原体と3つの細菌性病原体を検出できます。急性呼吸器感染症に苦しむ6歳未満の子供からの合計315の呼吸器サンプルは、8つの呼吸器ウイルスに対して、ラインウイルスのRT-PCRによって研究されました。その後、これらのサンプルはFilmArray-RPによってテストされました。テストされた9つのウイルスで得られた陽性頻度は、IF/RT-PCRで75%、FilmArray-RPで92%でした。両方の方法間の正と負の1つの一致は70.5%でしたが、マイナスパーセントの一致は99.6%(それぞれ95%信頼区間:65.5-75.1および99.2-99.8)でした。FilmArray-RPは、より高い陽性診断(97%)を可能にし(97%)、コロナウイルスNL63、229E、OC43、HKU1(10%)、ボカビロス(18%)などの他のウイルスを検出しました。さらに、この方法では、2、3、4、および最大5つの異なるウイルスで複数の共感染(39%)を特定しました。現在、呼吸器ウイルス診断のためにほとんどのラテンアメリカ諸国で最も頻繁に使用される方法である場合、その低コスト、同時に多数のサンプルを処理する能力、および最も頻繁なウイルスの結果の迅速な決定があります。5時間以内に利用可能。ただし、日常的な手順に分子法を組み込むと、これらの感染症の診断収量が大幅に増加します。
一般的にウイルスによって引き起こされる急性呼吸器感染症は、小児の罹患率と死亡率の重要な原因です。アルゼンチンでは、呼吸器ウイルスの検出に関する国家監視プログラムは、通常、免疫蛍光(IF)アッセイを使用して実行されますが、分子法はより敏感であることがよく知られています。自動化されたマルチプレックスPCRデバイスであるFilmArray-Respiratoryパネル(FilmArray-RP)は、閉じたシステムで17のウイルス性病原体と3つの細菌性病原体を検出できます。急性呼吸器感染症に苦しむ6歳未満の子供からの合計315の呼吸器サンプルは、8つの呼吸器ウイルスに対して、ラインウイルスのRT-PCRによって研究されました。その後、これらのサンプルはFilmArray-RPによってテストされました。テストされた9つのウイルスで得られた陽性頻度は、IF/RT-PCRで75%、FilmArray-RPで92%でした。両方の方法間の正と負の1つの一致は70.5%でしたが、マイナスパーセントの一致は99.6%(それぞれ95%信頼区間:65.5-75.1および99.2-99.8)でした。FilmArray-RPは、より高い陽性診断(97%)を可能にし(97%)、コロナウイルスNL63、229E、OC43、HKU1(10%)、ボカビロス(18%)などの他のウイルスを検出しました。さらに、この方法では、2、3、4、および最大5つの異なるウイルスで複数の共感染(39%)を特定しました。現在、呼吸器ウイルス診断のためにほとんどのラテンアメリカ諸国で最も頻繁に使用される方法である場合、その低コスト、同時に多数のサンプルを処理する能力、および最も頻繁なウイルスの結果の迅速な決定があります。5時間以内に利用可能。ただし、日常的な手順に分子法を組み込むと、これらの感染症の診断収量が大幅に増加します。
Acute respiratory infections, which are commonly caused by viruses, are an important cause of morbidity and mortality in children. In Argentina, national surveillance programs for the detection of respiratory viruses are usually performed by using immunofluorescence (IF) assays, although it is well known that molecular methods are more sensitive. An automated multiplex PCR device, the FilmArray-Respiratory Panel (FilmArray-RP), can detect 17 viral and 3 bacterial pathogens in a closed system that requires only 5 min of hands-on time and 1h of instrumentation time. A total of 315 respiratory samples from children under 6 years of age suffering from acute respiratory infections, were studied by IF for 8 respiratory viruses and by RT-PCR for rhinoviruses. Later, these samples were tested by the FilmArray-RP. The positivity frequency obtained for the 9 viruses tested was 75% by IF/RT-PCR and 92% by the FilmArray-RP. The positive and negative percent agreement between both methods was 70.5% whereas the negative percent agreement was 99.6% (95% confidence interval:65.5-75.1 and 99.2-99.8 respectively). The FilmArray-RP allowed a higher positive diagnosis (97%) and detected other viruses such as coronavirus NL63, 229E, OC43, HKU1 (10%) and bocavirus (18%). In addition, this method identified multiple coinfections (39%) with 2, 3, 4 and up to 5 different viruses. At present, IF is still the most frequently used method in most Latin American countries for respiratory viruses diagnosis due to its low cost, its capability to process a high number of samples simultaneously and the fast determination of results for the most frequent viruses, which are available within 5h. However, the coming incorporation of molecular methods in routine procedures will significantly increase the diagnostic yield of these infections.
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