rasp（系統の祖先状態を再構築）：歴史的な生物地理学のためのツール

系統樹の先祖の地理的分布を再構築することにより、歴史的生物地理学を推測するためのユーザーフレンドリーなソフトウェアパッケージである系統系の祖先状態の再構築のリリースを発表します。RASPは、広く使用されている統計分散副次分析（S-DIVA）、分散抑制 - 消滅クラドジェネシス（DEC）モデル（Lagrange）、統計DECモデル（S-DEC）、およびBayareaを利用します。グラフィカルユーザーインターフェイス（GUI）を提供して、系統樹またはツリーのセットと地理的分布の制約を指定し、系統樹のノードにパイチャートを描画して、不確実性のレベルを示し、高品質のエクスポート可能なグラフィカルな結果を生成します。RASPは、WindowsとMac OS Xの両方のプラットフォームで実行できます。RASPのすべてのドキュメントとソースコードは、http://mnh.scu.edu.cn/soft/blog/raspで無料で入手できます。

We announce the release of Reconstruct Ancestral State in Phylogenies (RASP), a user-friendly software package for inferring historical biogeography through reconstructing ancestral geographic distributions on phylogenetic trees. RASP utilizes the widely used Statistical-Dispersal Vicariance Analysis (S-DIVA), the Dispersal-Extinction-Cladogenesis (DEC) model (Lagrange), a Statistical DEC model (S-DEC) and BayArea. It provides a graphical user interface (GUI) to specify a phylogenetic tree or set of trees and geographic distribution constraints, draws pie charts on the nodes of a phylogenetic tree to indicate levels of uncertainty, and generates high-quality exportable graphical results. RASP can run on both Windows and Mac OS X platforms. All documentation and source code for RASP is freely available at http://mnh.scu.edu.cn/soft/blog/RASP.