転写産物の遺伝的変異の分布パターンは、ヒトゲノムの代替タンパク質コーディング遺伝子のアイソフォーム

同じ遺伝子遺伝子座からの複数のアイソフォームの転写を有効にすることにより、代替分割メカニズムはヒトのトランスクリプトームとプロテオームの多様性を大幅に拡大します。現在、ヒトゲノムの各タンパク質コーディング遺伝子遺伝子座からの交代的にスプライスされた転写産物は、主体の保存または生物学的特徴に関して異なることを条件として、主要または非原理のアイソフォームに分類できます。1000ゲノムプロジェクトから各アイソフォームのコーディング領域にバリエーションをマッピングすることにより、これら2つのタイプの転写産物アイソフォームのコード領域の遺伝的変異分布の興味深いパターンが全ゲノムスケールで明らかになりました。タンパク質機能に強い影響を与え、導出された対立遺伝子頻度が高く、非原理のアイソフォーム特異的な置換が表現型の変化や疾患に関連する可能性が低いことを示唆しています。ここでの結果は、人口の観点から、代替製品の潜在的な結果をよりよく理解するのに役立ちます。

By enabling the transcription of multiple isoforms from the same gene locus, alternative-splicing mechanisms greatly expand the diversity of the human transcriptome and proteome. Currently, the alternatively spliced transcripts from each protein-coding gene locus in the human genome can be classified as either principal or non-principal isoforms, providing that they differ with respect to cross-species conservation or biological features. By mapping the variants from the 1000 Genomes Project onto the coding region of each isoform, an interesting pattern of the genetic variation distributions of the coding regions for these two types of transcript isoforms was revealed on a whole-genome scale: compared with the principal isoform-specific coding regions, the non-principal isoform-specific coding regions are significantly enriched in amino acid-changing variants, particularly those that have a strong impact on protein function and have higher derived allele frequencies, suggesting that non-principal isoform-specific substitutions are less likely to be related to phenotype changes or disease. The results herein can help us better understand the potential consequences of alternatively spliced products from a population perspective.