エンドヌクレアーゼVによるDNAおよびRNAの分解アデニンでの切開の構造的基礎v

アデニン、グアニン、シトシンの外環式アミンの脱アミノ化は、DNA修復タンパク質によって除去されないと変異を引き起こす可能性のある塩基病変を形成します。原核生物のエンドヌクレアーゼV（Endov/NFI）は、アデニン、グアニン、シトシンの脱アデニンを含むさまざまな塩基病変にDNA 3 'を切開することが長い間知られています。生化学的および遺伝的データは、Endovがこれらの分離塩基の修復に関与していることに関係しています。ヌクレオベースの直接切除によりDNAの一連の修飾/損傷した塩基を除去するDNAグリコシラーゼとは対照的に、エンドフは、2番目のホスホディエステル3 'でDNA糖リン酸骨格を病変に分類しない塩基を除去せずに切断します。Endovによるこの異常な切開の構造的調査により、別々の塩基病変と活性部位ポケットを備えた酵素が解明されました。新しいウェッジモチーフは、損傷検出に重要なDNA鎖分離機能として特定されました。ヒトENDOVはDNAでは非アクティブに見えますが、イノシンを含むさまざまなRNA基質を切開することが示されています。イノシンはアデノシンの脱アミノ化産物であり、RNAで頻繁に発見されています。Human EndovによるDNAとRNAの識別の構造的基盤は、とらえどころのないままです。

Deamination of the exocyclic amines in adenine, guanine and cytosine forms base lesions that may lead to mutations if not removed by DNA repair proteins. Prokaryotic endonuclease V (EndoV/Nfi) has long been known to incise DNA 3' to a variety of base lesions, including deaminated adenine, guanine and cytosine. Biochemical and genetic data implicate that EndoV is involved in repair of these deaminated bases. In contrast to DNA glycosylases that remove a series of modified/damaged bases in DNA by direct excision of the nucleobase, EndoV cleaves the DNA sugar phosphate backbone at the second phosphodiester 3' to the lesion without removing the deaminated base. Structural investigation of this unusual incision by EndoV has unravelled an enzyme with separate base lesion and active site pockets. A novel wedge motif was identified as a DNA strand-separation feature important for damage detection. Human EndoV appears inactive on DNA, but has been shown to incise various RNA substrates containing inosine. Inosine is the deamination product of adenosine and is frequently found in RNA. The structural basis for discrimination between DNA and RNA by human EndoV remains elusive.