ハイスループットシーケンスに基づく感染性病原体の迅速な検出と同定

背景：不明な起源の発熱などの身元不明の臨床症状のある患者における病原体同定のジレンマが存在します。 方法：このレポートでは、偏りのないハイスループットシーケンスに基づいて、これまで正体不明の感染性病原体を調査する方法を開発することにより、正体不明の病原体の認識を高めようとしました。 結果：私たちの観察結果は、この方法が、主に集中治療室から5つのケースに由来する情報に依存している現在の診断技術を補完することを示しています。この方法論的アプローチは、ウイルスを検出し、はるかに短い期間で病原体の誤検出陽性検出率の発生率を修正します。私たちの方法に続いて、ポリメラーゼ連鎖反応検証が続き、エプスタインバーウイルスによる感染を特定でき、別の場合には、培養に基づいた連鎖球菌性ビリディアンの感染を特定することができました。 結論：この技術は、感染性病原体の迅速な診断に革命をもたらし、個別化医療の改善をもたらす可能性のある治療を導くための有望なアプローチです。

BACKGROUND: The dilemma of pathogens identification in patients with unidentified clinical symptoms such as fever of unknown origin exists, which not only poses a challenge to both the diagnostic and therapeutic process by itself, but also to expert physicians. METHODS: In this report, we have attempted to increase the awareness of unidentified pathogens by developing a method to investigate hitherto unidentified infectious pathogens based on unbiased high-throughput sequencing. RESULTS: Our observations show that this method supplements current diagnostic technology that predominantly relies on information derived five cases from the intensive care unit. This methodological approach detects viruses and corrects the incidence of false positive detection rates of pathogens in a much shorter period. Through our method is followed by polymerase chain reaction validation, we could identify infection with Epstein-Barr virus, and in another case, we could identify infection with Streptococcus viridians based on the culture, which was false positive. CONCLUSIONS: This technology is a promising approach to revolutionize rapid diagnosis of infectious pathogens and to guide therapy that might result in the improvement of personalized medicine.