緑膿菌のパルスフィールドゲル電気泳動

パルスフィールドゲル電気泳動 (PFGE) は、方向を定期的に変える電場を適用することにより、ゲルマトリックス上の消化された細菌ゲノム DNA から高分子量制限フラグメントを分離するために使用される技術です。PFGE は、利用可能な細菌株タイピング技術の中で最も識別性と再現性が高いことが示されています。これは、病原性微生物および非病原性微生物の疫学研究における「ゴールドスタンダード」と考えられています。この章では、日和見性グラム陰性細菌病原体緑膿菌の遺伝子型決定に PFGE を使用する詳細な方法を説明します。

Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) is a technique used for the separation of high molecular weight restriction fragments from digested bacterial genomic DNA on a gel matrix by applying an electric field that periodically changes direction. PFGE has been shown to be the most discriminatory and reproducible bacterial strain typing technique available. It is considered the 'gold standard' in epidemiological studies of pathogenic and nonpathogenic microorganisms. This chapter provides a detailed method for using PFGE in the genotyping of the opportunistic Gram-negative bacterial pathogen Pseudomonas aeruginosa.