SSRマーカーによって明らかにされたブラックグラム[Vigna Mungo（L）Hepper]遺伝子プールの遺伝的多様性

この研究では、22のSSRマーカーを使用して、520の栽培と14の黒いグラム（Vigna Mungo（L.）Hepper）の14の野生の登録が多様性を評価しました。完全に、199の対立遺伝子は、遺伝子座あたり平均9.05対立遺伝子で検出されました。野生の黒いグラムは、栽培された黒いグラムよりも高い遺伝子多様性を示しました。地域間の栽培された加工の遺伝子多様性は同等でしたが、南アジアの対立遺伝子の豊かさは他の地域の豊かさよりも高かった。培養された媒介で提示された野生の遺伝子多様性の78.67％は、黒いグラムの家畜化ボトルネック効果が比較的低いことを示しています。遺伝的距離分析により、栽培された黒いグラムは、東南アジアのそれよりも南アジアの野生の黒いグラムとより密接に関連していることが明らかになりました。構造、主要な座標、および隣接結合分析により、534個の黒いグラムの吹き込みが3つの主要な亜集団に分類されたことが一貫して明らかになりました。また、分析により、南アジアから栽培された黒いグラムが西アジアとは遺伝的に異なることが明らかになりました。Mungbean、Azuki Bean、Rice Beanを含む他の密接に関連するVigna種とのSSR分析による比較により、黒いグラムの遺伝子多様性のレベルはムンビーンとライスビーンのレベルに匹敵しますが、緑豆のレベルよりも低いことが明らかになりました。

In this study, 520 cultivated and 14 wild accessions of black gram (Vigna mungo (L.) Hepper) were assessed for diversity using 22 SSR markers. Totally, 199 alleles were detected with a mean of 9.05 alleles per locus. Wild black gram showed higher gene diversity than cultivated black gram. Gene diversity of cultivated accessions among regions was comparable, while allelic richness of South Asia was higher than that of other regions. 78.67% of the wild gene diversity presented in cultivated accessions, indicating that the domestication bottleneck effect in black gram is relatively low. Genetic distance analysis revealed that cultivated black gram was more closely related to wild black gram from South Asia than that from Southeast Asia. STRUCTURE, principal coordinate and neighbor-joining analyses consistently revealed that 534 black gram accessions were grouped into three major subpopulations. The analyses also revealed that cultivated black gram from South Asia was genetically distinct from that from West Asia. Comparison by SSR analysis with other closely related Vigna species, including mungbean, azuki bean, and rice bean, revealed that level of gene diversity of black gram is comparable to that of mungbean and rice bean but lower than that of azuki bean.