Anthramycin-D（ATGCAT）2付加物に関する2次元NMR研究

ヌクレオチド塩基および糖陽子、およびアンクレラマイシンプロトンの割り当てを得るために、2次元NMR実験をD（ATGCAT）2の付加物で実施しました。アントラマイシンはグアニン2-アミノ基に共有結合し、D（atamgcat）.d（atgcat）修飾二重鎖を形成します。マイナーグルーブのアントラマイシンプロトンは、いくつかのヌクレオチドプロトンにノーを示します。アンクラマイシンヌクレオチドNOESのネットワークと、アントラマイシンH11とH11Aプロトンの間の10 Hzカップリング定数の測定は、アンクラマイシンC11位置でAnthramycin C11の位置として、アンチュラマイシンの側鎖が修飾ストランドの端に向かって配向したSステレオ異性体として共有結合していることを示します。NOEのデータは、antramy類が修飾された二重鎖が抗水構造のすべての塩基と右利きの立体構造にあることを示しています。分解されたH1 '共鳴のJ1'-2'結合定数の分析は、糖のS型立体構造が非常に好ましいことを示しています。

Two-dimensional NMR experiments were performed on the adduct of anthramycin with d(ATGCAT)2 to obtain the assignments of the nucleotide base and sugar protons as well as the anthramycin protons. Anthramycin is covalently attached to a guanine 2-amino group, forming the d(ATamGCAT).d(ATGCAT) modified duplex. The anthramycin protons in the minor groove exhibit NOEs to several nucleotide protons. The network of anthramycin-nucleotide NOEs and the measurement of the 10-Hz coupling constant between the anthramycin H11 and H11a protons shows that anthramycin is covalently attached as the S stereoisomer at the anthramycin C11 position with the side chain of anthramycin oriented toward the 5' end of the modified strand. The NOE data show that the anthramycin-modified duplex is in a right-handed conformation with all bases in an anti conformation. Analysis of the J1'-2' coupling constants for the resolved H1' resonances shows that the S-type conformation of the sugars is highly preferred.