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ホメオボックスタンパク質のクラスに属するホメオドメイン - ロイシンジッパー（HD-ZIP）転写因子は、成長と発達、光態化、開花、果実の熟成、適応反応など、植物のさまざまな生物学的プロセスに関与していると報告されています。環境ストレス。この研究では、柑橘類で27のHD-ZIP遺伝子（CSHB）が同定されました。個々の遺伝子またはタンパク質の系統解析と特性に基づいて、柑橘類のHD-ZIP遺伝子ファミリーは4つのサブファミリー、つまりHD-ZIP I、HD-ZIP II、HD-ZIP III、およびHD-ZIP IVを含むHD-ZIP IVに分類できます。それぞれ16、2、4、および5メンバー。27のHD-ZIP遺伝子のデジタル発現パターンは、柑橘類のシネンシスのカルス、花、葉、果物で分析されました。選択された6つのHD-ZIP遺伝子のQRT-PCRおよびRT-PCR分析は、異なる胚性能力を持つ6つの柑橘類栽培品種と胚誘導段階で実行され、これらの遺伝子が差次的に発現し、柑橘類の体胚形成に関与している可能性があることが明らかになりました。se）。結果は、CSHB1の発現が体細胞胚誘導プロセスで上方制御されており、その発現は、体細胞胚を形成するために栽培品種の反発剤よりも胚形成能力が高い柑橘類品種で高かったことを示しました。さらに、18の柑橘類の遺伝子型の中でCSHB1遺伝子で3つのヌクレオチド反復のマイクロサテライト部位が見つかり、CSHB1遺伝子とカルス誘導の能力との関連性を示しています。
ホメオボックスタンパク質のクラスに属するホメオドメイン - ロイシンジッパー（HD-ZIP）転写因子は、成長と発達、光態化、開花、果実の熟成、適応反応など、植物のさまざまな生物学的プロセスに関与していると報告されています。環境ストレス。この研究では、柑橘類で27のHD-ZIP遺伝子（CSHB）が同定されました。個々の遺伝子またはタンパク質の系統解析と特性に基づいて、柑橘類のHD-ZIP遺伝子ファミリーは4つのサブファミリー、つまりHD-ZIP I、HD-ZIP II、HD-ZIP III、およびHD-ZIP IVを含むHD-ZIP IVに分類できます。それぞれ16、2、4、および5メンバー。27のHD-ZIP遺伝子のデジタル発現パターンは、柑橘類のシネンシスのカルス、花、葉、果物で分析されました。選択された6つのHD-ZIP遺伝子のQRT-PCRおよびRT-PCR分析は、異なる胚性能力を持つ6つの柑橘類栽培品種と胚誘導段階で実行され、これらの遺伝子が差次的に発現し、柑橘類の体胚形成に関与している可能性があることが明らかになりました。se）。結果は、CSHB1の発現が体細胞胚誘導プロセスで上方制御されており、その発現は、体細胞胚を形成するために栽培品種の反発剤よりも胚形成能力が高い柑橘類品種で高かったことを示しました。さらに、18の柑橘類の遺伝子型の中でCSHB1遺伝子で3つのヌクレオチド反復のマイクロサテライト部位が見つかり、CSHB1遺伝子とカルス誘導の能力との関連性を示しています。
The homeodomain-leucine zipper (HD-Zip) transcription factors, which belong to a class of Homeobox proteins, has been reported to be involved in different biological processes of plants, including growth and development, photomorphogenesis, flowering, fruit ripening and adaptation responses to environmental stresses. In this study, 27 HD-Zip genes (CsHBs) were identified in Citrus. Based on the phylogenetic analysis and characteristics of individual gene or protein, the HD-Zip gene family in Citrus can be classified into 4 subfamilies, i.e. HD-Zip I, HD-Zip II, HD-Zip III, and HD-Zip IV containing 16, 2, 4, and 5 members respectively. The digital expression patterns of 27 HD-Zip genes were analyzed in the callus, flower, leaf and fruit of Citrus sinensis. The qRT-PCR and RT-PCR analyses of six selected HD-Zip genes were performed in six citrus cultivars with different embryogenic competence and in the embryo induction stages, which revealed that these genes were differentially expressed and might be involved in citrus somatic embryogenesis (SE). The results exhibited that the expression of CsHB1 was up-regulated in somatic embryo induction process, and its expression was higher in citrus cultivars with high embryogenic capacity than in cultivars recalcitrant to form somatic embryos. Moreover, a microsatellite site of three nucleotide repeats was found in CsHB1 gene among eighteen citrus genotypes, indicating the possible association of CsHB1 gene to the capacity of callus induction.
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