レゴナリジン、ガーナのストレプトマイセス分離株のリナリジンリップの新しいメンバー

リナリジンは、このファミリーでは、これまでにまれな線形リボソーマシネシ化および翻訳後修飾ペプチド（RIPPS）（CypemycinとSGR-1832のみが同定されている）であり、2つのみが特定されています。レゴナリジン1は、化学分離、ペプチドゲノミクス、包括的な1および2-D NMR、および土壌細菌Streptomyces sp。CT34、ガーナのレゴンから収集された分離株。遺伝子クラスターのバイオインフォマティクス分析は、レゴナリジン1の生合成がシペマイシンおよびSGR-1832の生合成とは異なることを示唆しています。バイオインフォマティクスおよびペプチドゲノミクスの分析と一致して、1は合計9つのポストモディフィクション、8つのデヒドロブチリン残基と、C末端にカルボン酸を伴うN、N-ジメチル化N末端を持っています。レゴナリジン1は、新しいサブファミリーを含む2つの既知のリナリジンと構造的に異なります。NMR分光法を使用してリナリジンRIPPの2D構造を確立するのはこれが初めてです。

Linaridins are rare linear ribosomally-synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs) and only two, cypemycin and SGR-1832, in this family have been identified so far. Legonaridin 1 has been discovered as a new member of linaridins through chemical isolation, peptidogenomics, comprehensive 1- and 2-D NMR and advanced Marfey's analyses from the soil bacterium Streptomyces sp. CT34, an isolate collected from Legon, Ghana. Bioinformatics analysis of the gene cluster suggested that the biosynthesis of legonaridin 1 is different from those of cypemycin and SGR-1832. Consistent with bioinformatics and peptidogenomics analyses, 1 has a total of nine post-modifications, 8 dehydrobutyrine residues and a N,N-dimethylated N-terminus with a carboxylic acid at the C-terminus. Legonaridin 1 is structurally different from the two known linaridins comprising a new subfamily. This is the first time that NMR spectroscopy is used to establish the 2-D structure of a linaridin RiPP.