3D-QSAR（COMFA、COMFA-RG、COMSIA）およびAurora-Bキナーゼ阻害の構造的要件を調査するためのチエノピリミジンとチエノピリジン誘導体の分子ドッキング研究

オーロラ-Bキナーゼは、細胞周期イベントで重要な役割を果たし、スピンドルチェックポイントアセンブリの調節における重要な要因として特定されています。したがって、腫瘍学の分野で重要な標的として証明できます。3D-QSARモデルは、足場としてチエノピリミジンとチエノピリジンを含む文献で報告された54分の分子を使用して生成されました。すべての分子は、sybyl x1.2の蒸留関数を使用して整列しました。この生成されたCOMFA-RG（領域焦点）とCOMSIAの最適なモデルは、それぞれ0.97の相関係数R（2）NCVで統計的に有意であり、それぞれ0.70および0.72の1つの係数（LOO）Q（2）を残しました。最良のComsiaモデルは、記述子のさまざまな組み合わせを使用して構築され、すべてのモデルの中で統計的に重要であることが証明されました。最高のCOMFA-RGおよびCOMSIAモデルは、それぞれ0.86および0.88の満足のいく予測値（R（2）PRED）値を提供する12のテストセット分子によって検証されました。外部テストセットの検証は、20個の分子を使用して実行され、生物活性の満足のいく予測が見つかりました。活性化合物は、金モジュールによってタンパク質（PDB ID：4C2V）にドッキングされ、ATP結合領域でのアミノ酸との重要な相互作用が明らかになりました。これらのデータは、キナーゼリガンド相互作用を備えたメカニズムを理解するために実り多いかもしれないオーロラ-B阻害の洞察要件を調査しました。

Aurora-B kinase plays a crucial role in cell cycle events and is identified as an important factor in regulation of spindle check point assembly. Thus, it can be proved as an important target in the field of oncology. 3D-QSAR model was generated using 54 molecules reported in literature containing thienopyrimidine and thienopyridine as scaffolds. All molecules were aligned using Distill function in Sybyl X1.2. This generated best model of CoMFA-RG (Region focusing) and CoMSIA were statistically significant with correlation coefficient r(2)ncv of 0.97, for both & Leave one out coefficient (LOO) q(2) of 0.70 and 0.72, respectively. Best CoMSIA model was built up using various combination of descriptors and proved statistical significant among all models. Best CoMFA-RG and CoMSIA models were validated by 12 test set molecules giving satisfactory prediction (r(2)pred) values of 0.86 and 0.88, respectively. External test set validation was performed using 20 molecules and satisfactory prediction of their biological activity was found. Active compounds were docked on protein (PDB ID: 4C2V) by GOLD module and revealed important interactions with amino acids at ATP-binding region. These data explored insight requirements for Aurora-B inhibition which might be fruitful for understanding mechanisms with kinase ligand interactions.