界面活性剤を使用したDNAアプタマーの基質選択性の調節

核酸アプタマーには、生産の容易さや熱安定性の向上など、抗体と比較して多くの利点があります。アプタマーは、高濃度の界面活性剤の存在下でも機能する可能性があると仮定しました。ここでは、界面活性剤とのDNAアプタマーの適合性に関する最初の体系的な調査を報告します。中性およびアニオン性界面活性剤は、アプタマーが親水性標的分子を折りたたんで結合する能力にわずかな影響しかないことがわかります。さらに、ミセル内の疎水性標的分子の隔離により、おそらく界面活性剤を使用できるように、適切な基質結合選好を調節できることを実証します。一般的に使用される界面活性剤とのアプタマーの互換性は、潜在的なアプリケーションの範囲を拡大することが予想され、単純な添加物を使用してアプタマーの基質結合選好を調節する能力は、分析アプリケーションでの選択性を高めるための新しいルートを提供します。

Nucleic acid aptamers have a number of advantages compared to antibodies, including greater ease of production and increased thermal stability. We hypothesized that aptamers may also be capable of functioning in the presence of high concentrations of surfactants, which readily denature antibodies and other protein-based affinity reagents. Here we report the first systematic investigation into the compatibility of DNA aptamers with surfactants. We find that neutral and anionic surfactants have only a minor impact on the ability of aptamers to fold and bind hydrophilic target molecules. Additionally, we demonstrate that surfactants can be utilized to modulate the substrate binding preferences of aptamers, likely due to the sequestration of hydrophobic target molecules within micelles. The compatibility of aptamers with commonly used surfactants is anticipated to expand their scope of potential applications, and the ability to modulate the substrate binding preferences of aptamers using a simple additive provides a novel route to increasing their selectivity in analytical applications.