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Microbial drug resistance (Larchmont, N.Y.)2016Apr01Vol.22issue(3)

同じ患者から得られたイミペネム耐性クレブシエラ肺炎の識別と特性評価と感受性クレブシエラバリコラ分離株の識別と特性評価

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

Klebsiella variicolaは、Klebsiella pneumoniaeに密接に遺伝的に関連する細菌であり、一般に生化学試験によりK. Pneumoniaeと誤認されています。2つの細菌を区別するために、RPOB遺伝子の系統解析と、マルチプレックスポリメラーゼ連鎖反応(PCR)による両方の細菌種のユニークな遺伝子の同定(PCR)は、K. variicolaを確実に同定し、遺伝子型を確実に同定し、遺伝子型を提供します。近年、K。variicolaは、入院患者に敗血症をもたらし、血流感染症の頻繁な原因として、小児病院での病院内発生の原因として説明されています。本研究では、K。pneumoniaeとK. variicolaは、異なる抗菌薬感受性表現型と毒性決定因子の異なる遺伝子型を示すユニークな患者から分離されました。8つの臨床分離株が異なる時間間隔で得られました。すべて5か月間。分離株は、自動識別システムによってK. pneumoniaeとして特定されました。臨床(生化学試験)および分子(多重PCRおよびRPOB遺伝子)特性評価により、最初の6つの肺炎菌ST258分離株でイミペネム耐性が特定されました。最後に残っている2つの分離株は、感受性K. variicolaに対応していました。細菌種は、肺炎分離株K.でのみ同定された毒性関連の決定因子、特にfima、fimh、およびecprab fimbrialをコードする遺伝子の特定のプロファイルを示しました。ただし、ENTB(Enterobactin)、MRKD(Fimbrialアドヘシン)、UGE(エピメラーゼ)、尿素(ウレアーゼ)、およびWABG(トランスフェラーゼ)遺伝子は、両方の細菌種間で共有されました。最近の研究は、K。pneumoniaよりも高い死亡率をK. variicolaに与えると考えています。この研究は、同じ患者から分離された肺炎K.肺炎と密接に関連するK. variicolaの識別を強調しています。これら2つの細菌種を区別することの価値は、臨床的意義、異なる表現型と遺伝子型、およびそれらを同じ患者から分離できるという事実にあります。

Klebsiella variicolaは、Klebsiella pneumoniaeに密接に遺伝的に関連する細菌であり、一般に生化学試験によりK. Pneumoniaeと誤認されています。2つの細菌を区別するために、RPOB遺伝子の系統解析と、マルチプレックスポリメラーゼ連鎖反応(PCR)による両方の細菌種のユニークな遺伝子の同定(PCR)は、K. variicolaを確実に同定し、遺伝子型を確実に同定し、遺伝子型を提供します。近年、K。variicolaは、入院患者に敗血症をもたらし、血流感染症の頻繁な原因として、小児病院での病院内発生の原因として説明されています。本研究では、K。pneumoniaeとK. variicolaは、異なる抗菌薬感受性表現型と毒性決定因子の異なる遺伝子型を示すユニークな患者から分離されました。8つの臨床分離株が異なる時間間隔で得られました。すべて5か月間。分離株は、自動識別システムによってK. pneumoniaeとして特定されました。臨床(生化学試験)および分子(多重PCRおよびRPOB遺伝子)特性評価により、最初の6つの肺炎菌ST258分離株でイミペネム耐性が特定されました。最後に残っている2つの分離株は、感受性K. variicolaに対応していました。細菌種は、肺炎分離株K.でのみ同定された毒性関連の決定因子、特にfima、fimh、およびecprab fimbrialをコードする遺伝子の特定のプロファイルを示しました。ただし、ENTB(Enterobactin)、MRKD(Fimbrialアドヘシン)、UGE(エピメラーゼ)、尿素(ウレアーゼ)、およびWABG(トランスフェラーゼ)遺伝子は、両方の細菌種間で共有されました。最近の研究は、K。pneumoniaよりも高い死亡率をK. variicolaに与えると考えています。この研究は、同じ患者から分離された肺炎K.肺炎と密接に関連するK. variicolaの識別を強調しています。これら2つの細菌種を区別することの価値は、臨床的意義、異なる表現型と遺伝子型、およびそれらを同じ患者から分離できるという事実にあります。

Klebsiella variicola, a bacterium closely genetically related to Klebsiella pneumoniae, is commonly misidentified as K. pneumoniae by biochemical tests. To distinguish between the two bacteria, phylogenetic analysis of the rpoB gene and the identification of unique genes in both bacterial species by multiplex-polymerase chain reaction (PCR) provide the means to reliably identify and genotype K. variicola. In recent years, K. variicola has been described both as the cause of an intrahospital outbreak in a pediatric hospital, which resulted in sepsis in inpatients, and as a frequent cause of bloodstream infections. In the present study, K. pneumoniae and K. variicola were isolated from a unique patient displaying different antimicrobial susceptibility phenotypes and different genotypes of virulence determinants. Eight clinical isolates were obtained at different time intervals; all during a 5-month period. The isolates were identified as K. pneumoniae by an automated identification system. The clinical (biochemical test) and molecular (multiplex-PCR and rpoB gene) characterization identified imipenem resistance in the first six K. pneumoniae ST258 isolates, which encode the SHV-12 cephalosporinase and KPC-3 carbapenemase genes. The two last remaining isolates corresponded to susceptible K. variicola. The bacterial species showed a specific profile of virulence-associated determinants, specifically the fimA, fimH, and ecpRAB fimbrial-encoding genes identified only in K. pneumoniae isolates. However, the entb (enterobactin), mrkD (fimbrial adhesin), uge (epimerase), ureA (urease), and wabG (transferase) genes were shared between both bacterial species. Recent studies attribute a higher mortality rate to K. variicola than to K. pneumonia. This work highlights the identification of K. pneumoniae and the closely related K. variicola isolated from the same patient. The value of distinguishing between these two bacterial species is in their clinical significance, their different phenotypes and genotypes, and the fact that they can be isolated from the same patient.

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