大腸菌RNAポリメラーゼのSigma eサブユニットの同定：高温遺伝子発現に関与する2番目の代替Sigma因子

大腸菌の rpoH 遺伝子は、熱ショック遺伝子の熱誘導性転写に関与する 32 kD シグマ因子であるシグマ 32 をコードします。rpoH は少なくとも 3 つのプロモーターから転写されます。これらのプロモーターのうち 2 つは、主要なシグマ因子であるシグマ 70 を含む RNA ポリメラーゼによって認識されます。我々は、3 番目の rpoH プロモーター (rpoH P3) の認識に関与する因子を精製し、見かけの Mr が 24,000 の新規シグマ因子を含む RNA ポリメラーゼであることを同定しました。私たちがシグマ E と呼ぶこの新しいシグマは、分子量とプロモーター特異性の点で既知のシグマ因子とは異なります。シグマ E ホロ酵素は、我々がテストしたシグマ 70 またはシグマ 32 制御プロモーターを認識しませんが、42 ℃を超える温度での生存に必要な htrA 遺伝子を転写します。シグマ E の生体内での役割は不明です。。シグマ E 制御の rpoH P3 および htrA プロモーターからの転写物は非常に高温で最も豊富であり、シグマ E ホロ酵素が高温での増殖または耐熱性に関与する熱誘導性遺伝子の第 2 セットを転写する可能性があることを示唆しています。

The rpoH gene of Escherichia coli encodes sigma 32, the 32-kD sigma-factor responsible for the heat-inducible transcription of the heat shock genes. rpoH is transcribed from at least three promoters. Two of these promoters are recognized by RNA polymerase containing sigma 70, the predominant sigma-factor. We purified the factor responsible for recognizing the third rpoH promoter (rpoH P3) and identified it as RNA polymerase containing a novel sigma-factor with an apparent Mr of 24,000. This new sigma, which we call sigma E, is distinct from the known sigma factors in molecular weight and promoter specificity. sigma E holoenzyme will not recognize the sigma 70- or sigma 32-controlled promoters we tested, but it does transcribe the htrA gene, which is required for viability at temperatures greater than 42 degrees C. The in vivo role of sigma E is not known. The transcripts from the sigma E-controlled rpoH P3 and htrA promoters are most abundant at very high temperature, suggesting the sigma E holoenzyme may transcribe a second set of heat-inducible genes that are involved in growth at high temperature or in thermotolerance.