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IUBMB life2016Jun01Vol.68issue(6)

すべてのイノシンはどこに行ったのですか?高等真核生物のtrNAAcgargの抗コドンのA-t-I編集の矛盾する証拠は、CGNコドンの普遍的なぐらつき媒介デコードの教義に疑問を投げかけます

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

mRNA と特定の tRNA のトリプレット間のコドン-アンチコドン認識は、遺伝暗号の翻訳における重要な要素です。一般に、このプロセスの精度は、厳密なワトソンクリック塩基対形成スキームによって左右されます。しかし、遺伝暗号の縮重により、クリックはウォブル仮説を提案し、コドンの 3 番目の塩基との相互作用をあまり抑制せず、C 末端コドンの解読にイノシンが関与することを可能にしました。すべての真核生物、真正細菌、および植物葉緑体の tRNAACGArg のアンチコドン塩基 A34 が I34 に変換されるという概念は、高等真核生物の細胞質 tRNAACGArg に存在するという矛盾した証拠にもかかわらず、文献にしっかりと定着しています。ここでは、追加のデータを提供し、この立場の転写後の脱アミノ化を支持する議論と反対する議論を要約します。見かけ上の矛盾を解決する仮説が提案されます。© 2016 IUBMB ライフ、68(6):419-422、2016。

mRNA と特定の tRNA のトリプレット間のコドン-アンチコドン認識は、遺伝暗号の翻訳における重要な要素です。一般に、このプロセスの精度は、厳密なワトソンクリック塩基対形成スキームによって左右されます。しかし、遺伝暗号の縮重により、クリックはウォブル仮説を提案し、コドンの 3 番目の塩基との相互作用をあまり抑制せず、C 末端コドンの解読にイノシンが関与することを可能にしました。すべての真核生物、真正細菌、および植物葉緑体の tRNAACGArg のアンチコドン塩基 A34 が I34 に変換されるという概念は、高等真核生物の細胞質 tRNAACGArg に存在するという矛盾した証拠にもかかわらず、文献にしっかりと定着しています。ここでは、追加のデータを提供し、この立場の転写後の脱アミノ化を支持する議論と反対する議論を要約します。見かけ上の矛盾を解決する仮説が提案されます。© 2016 IUBMB ライフ、68(6):419-422、2016。

Codon-anticodon recognition between triplets of an mRNA and a specific tRNA is the key element in the translation of the genetic code. In general, the precision of this process is dominated by a strict Watson-Crick base-pairing scheme. However, the degeneracy of the genetic code led Crick to propose the Wobble Hypothesis, permitting a less restraining interaction with the third base of the codon and involving the participation of inosine for decoding C-ending codons. The concept that the anticodon base A34 of tRNAACGArg in all eukaryotes, eubacteria, and plant chloroplasts is converted to I34 is firmly anchored in the literature despite conflicting evidence for its existence in higher eukaryote cytoplasmic tRNAACGArg. Here, we provide additional data and summarize the arguments favoring and contradicting post-transcriptional deamination of this position. A hypothesis that resolves the apparent conflict is proposed. © 2016 IUBMB Life, 68(6):419-422, 2016.

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