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Parasitology2016Jul01Vol.143issue(8)

Anisakis Pegreffii、シンプレックス(S)およびハイブリダイゼーションイベントの検出に「シングル」と留まる時間はありません。

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

Anisakis sppの幼虫および成体標本でマルチマーカーの核遺伝子型付けアプローチを実施しました。(n = 689)次のように、次のように、2つの種Anisakis pegreffiiとAnisakis Simplex(s。s。)の2つの種のアロパトリックおよび同所性領域の魚と介管から収集されました。新しい診断核DNA遺伝子座の配列分析(すなわち、EF1の部分配列α-1 nDNA領域)および(2)はハイブリッドカテゴリを認識します。これらのマーカーに基づいて、ベイジアンクラスタリングアルゴリズムによると、ほとんどの個人(n = 678)は親の種として識別されました[すなわち。A. pegreffiiまたはA. simplex(s。s。)]、一方、より小さな部分(n = 11)はF1ハイブリッドとして認識されていました。同じ標本上の内部転写スペーサー(ITS)リボソームDNA(RDNA)のポリメラーゼ連鎖反応反応断片的長さ多型(PCR-RFLPS)を使用すると、不一致の結果が得られました。SympatryとAllopatryの両方で。これらの発見は、2つの親アニサキスに属する標本と、その単一マーカーの適用に由来するハイブリッドカテゴリに属する​​可能性のある誤認の問題を提起します(すなわち、RDNAのPCR-RFLPS分析)。最後に、アロザイムとEF1α-1 nDNAマーカーを使用したベイジアンクラスタリングは、A。pegreffiiとA.シンプレックス(s。s。)の間のハイブリダイゼーションは、同所領域の現代現象であり、2つの種の間では身体的なハイブリダイゼーションは行われないことを実証しました。

Anisakis sppの幼虫および成体標本でマルチマーカーの核遺伝子型付けアプローチを実施しました。(n = 689)次のように、次のように、2つの種Anisakis pegreffiiとAnisakis Simplex(s。s。)の2つの種のアロパトリックおよび同所性領域の魚と介管から収集されました。新しい診断核DNA遺伝子座の配列分析(すなわち、EF1の部分配列α-1 nDNA領域)および(2)はハイブリッドカテゴリを認識します。これらのマーカーに基づいて、ベイジアンクラスタリングアルゴリズムによると、ほとんどの個人(n = 678)は親の種として識別されました[すなわち。A. pegreffiiまたはA. simplex(s。s。)]、一方、より小さな部分(n = 11)はF1ハイブリッドとして認識されていました。同じ標本上の内部転写スペーサー(ITS)リボソームDNA(RDNA)のポリメラーゼ連鎖反応反応断片的長さ多型(PCR-RFLPS)を使用すると、不一致の結果が得られました。SympatryとAllopatryの両方で。これらの発見は、2つの親アニサキスに属する標本と、その単一マーカーの適用に由来するハイブリッドカテゴリに属する​​可能性のある誤認の問題を提起します(すなわち、RDNAのPCR-RFLPS分析)。最後に、アロザイムとEF1α-1 nDNAマーカーを使用したベイジアンクラスタリングは、A。pegreffiiとA.シンプレックス(s。s。)の間のハイブリダイゼーションは、同所領域の現代現象であり、2つの種の間では身体的なハイブリダイゼーションは行われないことを実証しました。

A multi-marker nuclear genotyping approach was performed on larval and adult specimens of Anisakis spp. (N = 689) collected from fish and cetaceans in allopatric and sympatric areas of the two species Anisakis pegreffii and Anisakis simplex (s. s.), in order to: (1) identify specimens belonging to the parental taxa by using nuclear markers (allozymes loci) and sequence analysis of a new diagnostic nuclear DNA locus (i.e. partial sequence of the EF1 α-1 nDNA region) and (2) recognize hybrid categories. According to the Bayesian clustering algorithms, based on those markers, most of the individuals (N = 678) were identified as the parental species [i.e. A. pegreffii or A. simplex (s. s.)], whereas a smaller portion (N = 11) were recognized as F1 hybrids. Discordant results were obtained when using the polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphisms (PCR-RFLPs) of the internal transcribed spacer (ITS) ribosomal DNA (rDNA) on the same specimens, which indicated the occurrence of a large number of 'hybrids' both in sympatry and allopatry. These findings raise the question of possible misidentification of specimens belonging to the two parental Anisakis and their hybrid categories derived from the application of that single marker (i.e. PCR-RFLPs analysis of the ITS of rDNA). Finally, Bayesian clustering, using allozymes and EF1 α-1 nDNA markers, has demonstrated that hybridization between A. pegreffii and A. simplex (s. s.) is a contemporary phenomenon in sympatric areas, while no introgressive hybridization takes place between the two species.

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