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Journal of biotechnology2016Jul10Vol.229issue()

内部および末期に配置されたアラビノフラノシル枝での3つのGH51および1つのGH54α-アラビノフラノシダーゼの作用

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

3つのグリコシドヒドロラーゼファミリーGH51と1つのGH54α-アラビノフラノシダーゼ(ABF)の作用は、ポリマーアラビノキシランとアラビノキシルオリゴ糖で研究されました。基質は、可能なすべてのアラビノフラノシル(ARAF)置換基、すなわち末端および内部α(1→2)およびα(1→3)にリンクされたARAF単堆積物および障害をカバーしました。GH51 ABFは、末端の非還元末端キシラノシル(Xylp)残基からほぼすべての単像および否定を除去し、デュアルABF-M/D活性を示しました。内部XYLPから、GH51 Aspergillus Niger ABFでの治療後を除き、主に単筋層が除去されました。同様にゆっくりと内部の不正確さを分解し、GH51内の基質特異性の汎用性を示しました。GH54 Trichoderma reeSei ABFコアタンパク質もデュアルABF-M/D活性を示し、ターミナルと内部の両方の位置からゆっくりと分解されます。驚くべきことに、T。reeseiABFの再選択性は、端末xylp上のα(1→3)リンクされたARAFから、モノおよび不調和の両方で内部xylp上のα(1→2)リンクARAFに変化しました。結論として、天然基質の系統的解析により、T。reeseiABFの興味深い新しい詳細が明らかになり、特にGH51 ABF内で、デュアルABF-M/D活性が以前に考えられていたよりも一般的であることが示されました。

3つのグリコシドヒドロラーゼファミリーGH51と1つのGH54α-アラビノフラノシダーゼ(ABF)の作用は、ポリマーアラビノキシランとアラビノキシルオリゴ糖で研究されました。基質は、可能なすべてのアラビノフラノシル(ARAF)置換基、すなわち末端および内部α(1→2)およびα(1→3)にリンクされたARAF単堆積物および障害をカバーしました。GH51 ABFは、末端の非還元末端キシラノシル(Xylp)残基からほぼすべての単像および否定を除去し、デュアルABF-M/D活性を示しました。内部XYLPから、GH51 Aspergillus Niger ABFでの治療後を除き、主に単筋層が除去されました。同様にゆっくりと内部の不正確さを分解し、GH51内の基質特異性の汎用性を示しました。GH54 Trichoderma reeSei ABFコアタンパク質もデュアルABF-M/D活性を示し、ターミナルと内部の両方の位置からゆっくりと分解されます。驚くべきことに、T。reeseiABFの再選択性は、端末xylp上のα(1→3)リンクされたARAFから、モノおよび不調和の両方で内部xylp上のα(1→2)リンクARAFに変化しました。結論として、天然基質の系統的解析により、T。reeseiABFの興味深い新しい詳細が明らかになり、特にGH51 ABF内で、デュアルABF-M/D活性が以前に考えられていたよりも一般的であることが示されました。

The action of three glycoside hydrolase family GH51 and one GH54 α-arabinofuranosidases (ABFs) was studied on polymeric arabinoxylan and arabinoxylooligosaccharides. The substrates covered all possible arabinofuranosyl (Araf) substituents, i.e., terminal and internal α(1→2) and α(1→3)-linked Araf monosubstitutions and disubstitutions. The GH51 ABFs removed nearly all mono- and disubstitutions from terminal non-reducing end xylopyranosyl (Xylp) residues, showing dual ABF-m/d activity. From internal Xylp, primarily monosubstitutions were removed, except after treatment with GH51 Aspergillus niger ABF. It degraded slowly internal disubstitutions as well, showing versatility in substrate specificity within GH51. GH54 Trichoderma reesei ABF core protein also presented dual ABF-m/d activity, slowly degrading Araf disubstitutions from both terminal and internal positions. Surprisingly, regioselectivity of the T. reesei ABF changed from α(1→3)-linked Araf on terminal Xylp to α(1→2)-linked Araf on internal Xylp on both mono- and disubstitutions. In conclusion, systematic analysis of natural substrates revealed interesting new details on the action T. reesei ABF and showed that the dual ABF-m/d activity could be more prevalent than previously thought, especially within GH51 ABFs.

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