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FEMS microbiology letters2016Aug01Vol.363issue(15)

アパラチア豆南部の候補アルファプロテオバクテリア順序(エリン329)の新規分離株と広範な豊富さ

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
  • Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
概要
Abstract

すべての緯度の泥炭地は、炭素流しおよび大気メタンの主要な供給源として機能することにより、世界の気候変動に不可欠な役割を果たします。ただし、中心泥炭地の微生物生態学は非常に研究されています。ここで、小さなサブユニットrRNA遺伝子の次世代イルミナアンプリコンシーケンスを利用して、アパラチア南部の3つの泥炭地の微生物群集を解明しました。北部の泥炭地とは対照的に、プロテオバクテリアは3つのサイトすべてでアシドバクテリアよりも支配的でした。平均11の細菌門が1%を超える相対存在値値で検出され、3つの候補部門(OP3、WS3、およびNC10)が表現され、系統発生の多様性が高いことを示しています。ここで得られた候補のアルファプロテオバクテリア順、エリン329内の分離株の生理的特性は、この順序の細菌が多糖類、二糖、および単糖の加水分解に関与している可能性があることを示しています。コミュニティの分析は、エリン329が3番目に豊富な順序であり、植物の同腹仔分解が主に発生する表面層の近くで最も豊富であることを示しています。要するに、エリン329のメンバーは、アパラチア南部の泥炭地で有機物の分解において重要な役割を果たす可能性があり、他の泥炭地や生態系タイプでさらに調査する必要があります。

すべての緯度の泥炭地は、炭素流しおよび大気メタンの主要な供給源として機能することにより、世界の気候変動に不可欠な役割を果たします。ただし、中心泥炭地の微生物生態学は非常に研究されています。ここで、小さなサブユニットrRNA遺伝子の次世代イルミナアンプリコンシーケンスを利用して、アパラチア南部の3つの泥炭地の微生物群集を解明しました。北部の泥炭地とは対照的に、プロテオバクテリアは3つのサイトすべてでアシドバクテリアよりも支配的でした。平均11の細菌門が1%を超える相対存在値値で検出され、3つの候補部門(OP3、WS3、およびNC10)が表現され、系統発生の多様性が高いことを示しています。ここで得られた候補のアルファプロテオバクテリア順、エリン329内の分離株の生理的特性は、この順序の細菌が多糖類、二糖、および単糖の加水分解に関与している可能性があることを示しています。コミュニティの分析は、エリン329が3番目に豊富な順序であり、植物の同腹仔分解が主に発生する表面層の近くで最も豊富であることを示しています。要するに、エリン329のメンバーは、アパラチア南部の泥炭地で有機物の分解において重要な役割を果たす可能性があり、他の泥炭地や生態系タイプでさらに調査する必要があります。

Peatlands of all latitudes play an integral role in global climate change by serving as a carbon sink and a primary source of atmospheric methane; however, the microbial ecology of mid-latitude peatlands is vastly understudied. Herein, next generation Illumina amplicon sequencing of small subunit rRNA genes was utilized to elucidate the microbial communities in three southern Appalachian peatlands. In contrast to northern peatlands, Proteobacteria dominated over Acidobacteria in all three sites. An average of 11 bacterial phyla was detected at relative abundance values >1%, with three candidate divisions (OP3, WS3 and NC10) represented, indicating high phylogenetic diversity. Physiological traits of isolates within the candidate alphaproteobacterial order, Ellin 329, obtained here and in previous studies indicate that bacteria of this order may be involved in hydrolysis of poly-, di- and monosaccharides. Community analyses indicate that Ellin 329 is the third most abundant order and is most abundant near the surface layers where plant litter decomposition should be primarily occurring. In sum, members of Ellin 329 likely play important roles in organic matter decomposition, in southern Appalachian peatlands and should be investigated further in other peatlands and ecosystem types.

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