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目的:Staphylococcus argenteusが中国東部に存在するかどうかを調査し、新しいスクリーニングプロセスの有用性を検証します。 材料と方法:表現型観察、仮想的な非リボソームペプチドシンテターゼ(NRPS)遺伝子を標的とするPCRアッセイ、RPOBおよび多焦点配列タイピングの系統発生分析を使用して、839の推定S. aureus分離株のS. argenteusの株をスクリーニングおよび同定しました。 結果:推定S. gureus分離株の89(89/839、10.6%)は、トリプトン大豆寒天プレートに白いコロニーを生成しました。ホワイトコロニー分離株のうち、6人(6/89、7%)がS. argenteus、75人(75/89、84%)がS. aureus、8人(8/89、9%)が他の細菌でした。 結論:NRPS遺伝子を標的とするPCRベースの方法は、S。argenteusとS. aureusを同時に識別し、区別できます。この研究で生成されたRPOBのすべての代表的なシーケンスは、GenBankにSJTU F20002、KT767581の下でGenBankに堆積しました。SJTU F20269、KT767582;SJTU F20419、KT767583;SJTU F20420、KT767584;SJTU F20124、KT767585;SJTU F21164、KT767586;SJTU F21285、KT767587;SJTU F21224、KT767588;SJTU F21155、KT767589;SJTU F21294、KT767590;SJTU F20030、KT767591;SJTU F20044、KT767592;SJTU F20135、KT767593;SJTU F20123、KT767594;それぞれSJTU F21319、KT767595。すべての新しいシーケンスタイプ(STS)は、多焦点シーケンスタイピングデータベースに提出され、割り当てられたST番号はST3261(151-469-201-145-150-131)、ST3262(12-3-1-1-4-4-410)およびST3267(2-471-2-2-6-3-2)です。
目的:Staphylococcus argenteusが中国東部に存在するかどうかを調査し、新しいスクリーニングプロセスの有用性を検証します。 材料と方法:表現型観察、仮想的な非リボソームペプチドシンテターゼ(NRPS)遺伝子を標的とするPCRアッセイ、RPOBおよび多焦点配列タイピングの系統発生分析を使用して、839の推定S. aureus分離株のS. argenteusの株をスクリーニングおよび同定しました。 結果:推定S. gureus分離株の89(89/839、10.6%)は、トリプトン大豆寒天プレートに白いコロニーを生成しました。ホワイトコロニー分離株のうち、6人(6/89、7%)がS. argenteus、75人(75/89、84%)がS. aureus、8人(8/89、9%)が他の細菌でした。 結論:NRPS遺伝子を標的とするPCRベースの方法は、S。argenteusとS. aureusを同時に識別し、区別できます。この研究で生成されたRPOBのすべての代表的なシーケンスは、GenBankにSJTU F20002、KT767581の下でGenBankに堆積しました。SJTU F20269、KT767582;SJTU F20419、KT767583;SJTU F20420、KT767584;SJTU F20124、KT767585;SJTU F21164、KT767586;SJTU F21285、KT767587;SJTU F21224、KT767588;SJTU F21155、KT767589;SJTU F21294、KT767590;SJTU F20030、KT767591;SJTU F20044、KT767592;SJTU F20135、KT767593;SJTU F20123、KT767594;それぞれSJTU F21319、KT767595。すべての新しいシーケンスタイプ(STS)は、多焦点シーケンスタイピングデータベースに提出され、割り当てられたST番号はST3261(151-469-201-145-150-131)、ST3262(12-3-1-1-4-4-410)およびST3267(2-471-2-2-6-3-2)です。
AIM: To investigate whether the Staphylococcus argenteus is present in Eastern China and to verify the utility of a new screening process. MATERIALS & METHODS: Phenotype observation, PCR assay targeting a hypothetical nonribosomal peptide synthetase (NRPS) gene, phylogenetic analysis of rpoB and multilocus sequence typing were used to screen and identify strains of S. argenteus from 839 presumptive S. aureus isolates. RESULTS: Eighty-nine (89/839, 10.6%) of the presumptive S. aureus isolates produced white colonies on tryptone soya agar plates. Of the white-colony isolates, six (6/89, 7%) were S. argenteus, 75 (75/89, 84%) were S. aureus and eight (8/89, 9%) were other bacteria. CONCLUSION: The PCR-based method targeting the NRPS gene can simultaneously identify and distinguish S. argenteus and S. aureus. All representative sequences of rpoB generated in this study were deposited in GenBank under accession numbers SJTU F20002, KT767581; SJTU F20269, KT767582; SJTU F20419, KT767583; SJTU F20420, KT767584; SJTU F20124, KT767585; SJTU F21164, KT767586; SJTU F21285, KT767587; SJTU F21224, KT767588; SJTU F21155, KT767589; SJTU F21294, KT767590; SJTU F20030, KT767591; SJTU F20044, KT767592; SJTU F20135, KT767593; SJTU F20123, KT767594; SJTU F21319, KT767595, respectively. All the new sequence types (STs) were submitted to a multilocus sequence typing database and the assigned ST numbers are ST3261 (151-469-20-101-145-150-131), ST3262 (12-3-1-1-4-4-410) and ST3267 (2-471-2-2-6-3-2).
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