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Molecular phylogenetics and evolution2016Dec01Vol.105issue()

新世界のハゲタカの間の多焦点系統発生推論(aves:cathartidae)

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

新世界のハゲタカは、カタルティダ科の大体腐肉を摂食する鳥であり、現在、北アメリカと南アメリカに地理的分布を備えた5つの属の7種で構成されています。これまでの研究では、単一の系統解析にすべてのカタルティッド種が含まれていません。この研究では、5つの核(NUC; 4060bp)と化石校正遺伝子ツリー(27アウトグループ分類群)と合体ベースの種ツリーを使用した2つのミトコンドリア(MT; 2165bp)DNA遺伝子座を使用して、すべてのカタリッド種間の系統発生関係を調査しました。分類群)分析。また、種のツリー分析に追加の4つの核遺伝子座(2578bp)を含めて、結節のサポート値の変化を調査しました。STEM系統は約69万年前(MA; 74.5-64.9信頼できる間隔)から発生したと推測されていますが、カタルティダエ内のより最近の基底分裂は、〜14MA(17.1-11.1信頼できる間隔)で回収されました。2つの主要なクレードが特定されました:(1)黒いハゲタカ(Coragyps atratus)と3つのカタルテス種(Lesser C. burrovianus and C. Melambrotusの黄色い頭のハゲタカ、および七面鳥のハゲワシC. aura)、および(2)King Vultureture(Sarcoramphus papa)、カリフォルニア(Gymnogyps californianus)およびアンデス(Vultur gryphus)コンドル。2つの基底クレード内の分類群関係へのサポートは、単系統のカタルテスクレードの黒人ハゲタカの姉妹を除き、分析間で一貫していませんでした。4つの追加の核遺伝子座を使用して、種のツリー分析では、黄色のハゲタカのクレードに対するサポートの増加が回収されました。全体的に、これらの結果は、地理的分布が重複する姉妹分類群の間で、Cathartidの生活史(たとえば、嗅覚能力と行動)と対照的な生息地の親和性と一致しています。種分化が比較的短期間で発生したように見えるため、2つの基底カタルティッドクレード内の系統関係をさらに解決するために、追加の分子遺伝子座を使用してさらに研究が必要です。

新世界のハゲタカは、カタルティダ科の大体腐肉を摂食する鳥であり、現在、北アメリカと南アメリカに地理的分布を備えた5つの属の7種で構成されています。これまでの研究では、単一の系統解析にすべてのカタルティッド種が含まれていません。この研究では、5つの核(NUC; 4060bp)と化石校正遺伝子ツリー(27アウトグループ分類群)と合体ベースの種ツリーを使用した2つのミトコンドリア(MT; 2165bp)DNA遺伝子座を使用して、すべてのカタリッド種間の系統発生関係を調査しました。分類群)分析。また、種のツリー分析に追加の4つの核遺伝子座(2578bp)を含めて、結節のサポート値の変化を調査しました。STEM系統は約69万年前(MA; 74.5-64.9信頼できる間隔)から発生したと推測されていますが、カタルティダエ内のより最近の基底分裂は、〜14MA(17.1-11.1信頼できる間隔)で回収されました。2つの主要なクレードが特定されました:(1)黒いハゲタカ(Coragyps atratus)と3つのカタルテス種(Lesser C. burrovianus and C. Melambrotusの黄色い頭のハゲタカ、および七面鳥のハゲワシC. aura)、および(2)King Vultureture(Sarcoramphus papa)、カリフォルニア(Gymnogyps californianus)およびアンデス(Vultur gryphus)コンドル。2つの基底クレード内の分類群関係へのサポートは、単系統のカタルテスクレードの黒人ハゲタカの姉妹を除き、分析間で一貫していませんでした。4つの追加の核遺伝子座を使用して、種のツリー分析では、黄色のハゲタカのクレードに対するサポートの増加が回収されました。全体的に、これらの結果は、地理的分布が重複する姉妹分類群の間で、Cathartidの生活史(たとえば、嗅覚能力と行動)と対照的な生息地の親和性と一致しています。種分化が比較的短期間で発生したように見えるため、2つの基底カタルティッドクレード内の系統関係をさらに解決するために、追加の分子遺伝子座を使用してさらに研究が必要です。

New World Vultures are large-bodied carrion feeding birds in the family Cathartidae, currently consisting of seven species from five genera with geographic distributions in North and South America. No study to date has included all cathartid species in a single phylogenetic analysis. In this study, we investigated the phylogenetic relationships among all cathartid species using five nuclear (nuc; 4060bp) and two mitochondrial (mt; 2165bp) DNA loci with fossil calibrated gene tree (27 outgroup taxa) and coalescent-based species tree (2 outgroup taxa) analyses. We also included an additional four nuclear loci (2578bp) for the species tree analysis to explore changes in nodal support values. Although the stem lineage is inferred to have originated ∼69 million years ago (Ma; 74.5-64.9 credible interval), a more recent basal split within Cathartidae was recovered at ∼14Ma (17.1-11.1 credible interval). Two primary clades were identified: (1) Black Vulture (Coragyps atratus) together with the three Cathartes species (Lesser C. burrovianus and Greater C. melambrotus Yellow-headed Vultures, and Turkey Vulture C. aura), and (2) King Vulture (Sarcoramphus papa), California (Gymnogyps californianus) and Andean (Vultur gryphus) Condors. Support for taxon relationships within the two basal clades were inconsistent between analyses with the exception of Black Vulture sister to a monophyletic Cathartes clade. Increased support for a yellow-headed vulture clade was recovered in the species tree analysis using the four additional nuclear loci. Overall, these results are in agreement with cathartid life history (e.g. olfaction ability and behavior) and contrasting habitat affinities among sister taxa with overlapping geographic distributions. More research is needed using additional molecular loci to further resolve the phylogenetic relationships within the two basal cathartid clades, as speciation appeared to have occurred in a relatively short period of time.

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