SP1およびNF-κB要素の違いは、遺伝子発現を駆動するための中国のHIV-1 B'-LTRのより大きな能力と相関しています

HIV-1ロングターミナルリピート（LTR）の5 '末端は、ウイルス遺伝子転写の駆動に不可欠な役割を果たすプロモーターとして機能します。HIV-1 LTRの操作は、ウイルス遺伝子発現を抑制したり、統合されたプロビラを切除したりするための潜在的な治療戦略を提供します。LTR領域のサブタイプ特異的な遺伝的多様性が観察されています。特に転写因子結合部位でのLTRの軽微な分散は、その活動に大きな影響を与える可能性があります。ただし、主要な風土病の中国のサブタイプからのLTRプロファイルは、あまり特徴付けられていません。ここでは、風土病の中国のHIV-1サブタイプからのLTRの配列と機能を特徴付けることにより、SP1コアプロモーターとNF-κB要素のヌクレオチド分散が、ウイルス遺伝子転写を駆動するためのさまざまなLTR能力に関連していることを示しました。刺激時にウイルス遺伝子転写を促進するための中国のHIV-1 B'-LTRのより大きな応答性は、ウイルス再活性化のレベルの増加と関連しています。さらに、SP1またはNF-κB要素を標的とするCRISPR/DEAD CAS9の導入がウイルス遺伝子発現を抑制することを実証しました。まとめると、私たちの研究は、中国の風土病HIV-1サブタイプからのLTRを特徴づけ、ウイルス遺伝子発現の抑制の潜在的な標的と、機能的治療の達成を促進する新しい戦略を示唆しています。

The 5' end of HIV-1 long terminal repeat (LTR) serves as a promoter that plays an essential role in driving viral gene transcription. Manipulation of HIV-1 LTR provides a potential therapeutic strategy for suppressing viral gene expression or excising integrated provirus. Subtype-specific genetic diversity in the LTR region has been observed. The minor variance of LTR, particularly in the transcription factor binding sites, can have a profound impact on its activity. However, the LTR profiles from major endemic Chinese subtypes are not well characterized. Here, by characterizing the sequences and functions of LTRs from endemic Chinese HIV-1 subtypes, we showed that nucleotide variances of Sp1 core promoter and NF-κB element are associated with varied LTR capacity for driving viral gene transcription. The greater responsiveness of Chinese HIV-1 B'-LTR for driving viral gene transcription upon stimulation is associated with an increased level of viral reactivation. Moreover, we demonstrated that the introduction of CRISPR/dead Cas9 targeting Sp1 or NF-κB element suppressed viral gene expression. Taken together, our study characterized LTRs from endemic HIV-1 subtypes in China and suggests a potential target for the suppression of viral gene expression and a novel strategy that facilitates the accomplishment of a functional cure.