茶色のネズミ（Rattus norvegicus）の世界集団の発散と混合物

中国とモンゴル出身の茶色のネズミ（Rattus norvegicus）は現在、世界的な流通を享受しています。ブラックラットとハウスマウスは人間の農業集落の地域開発を追跡しましたが、1500年代まで茶色のラットはヨーロッパに現れませんでした。32 K SNPを使用して茶色のラットのグローバルな系統地理学を推測し、5つの拡張ルート内で13の進化クラスターを検出しました。南東アジアへの南向きの拡張に続いて、1つのクラスターが発生しました。2つの独立した東向きの拡張から3つの追加のクラスターが発生しました。1つはロシアからアリューシャン諸島への拡張と北アメリカ西部への拡張です。西方向の拡大により、ヨーロッパの植民地化が行われ、そこからアフリカ、アメリカ、オーストラリアの急速な植民地化が発生し、複数の進化的クラスターが検出されました。サンプリングサイトの間および内部の驚くほどの細かいクラスタリングの程度は、都市の不均一性が共生げっ歯類の遺伝的構造を形作った程度を強調しました。驚くべきことに、最近の移民はほとんどいなかったため、確立された集団への募集が限られていることを示唆しています。R. norvegicusの世界的な人口構造を理解することは、人獣共通感染症のspread延を駆り立てる力に関する新しい視点と、ラット根絶プログラムの開発を支援します。

Native to China and Mongolia, the brown rat (Rattus norvegicus) now enjoys a worldwide distribution. While black rats and the house mouse tracked the regional development of human agricultural settlements, brown rats did not appear in Europe until the 1500s, suggesting their range expansion was a response to relatively recent increases in global trade. We inferred the global phylogeography of brown rats using 32 k SNPs, and detected 13 evolutionary clusters within five expansion routes. One cluster arose following a southward expansion into Southeast Asia. Three additional clusters arose from two independent eastward expansions: one expansion from Russia to the Aleutian Archipelago, and a second to western North America. Westward expansion resulted in the colonization of Europe from which subsequent rapid colonization of Africa, the Americas and Australasia occurred, and multiple evolutionary clusters were detected. An astonishing degree of fine-grained clustering between and within sampling sites underscored the extent to which urban heterogeneity shaped genetic structure of commensal rodents. Surprisingly, few individuals were recent migrants, suggesting that recruitment into established populations is limited. Understanding the global population structure of R. norvegicus offers novel perspectives on the forces driving the spread of zoonotic disease, and aids in development of rat eradication programmes.