RNA-seqテクノロジーを使用した開発中および季節変動中のChinary、Assamica、Cambod Tea（Camellia sinensis）タイプの比較トランスクリプトーム分析

茶の品質と収量は、発達組織、季節変動、栽培品種の種類など、さまざまな要因の影響を受けます。ここで、これらの因子の分子基盤は、RNA-seqを使用して、3つの茶栽培品種で調査されました。これらの栽培品種の季節変動は、2つの発達組織の活動（a）、ミッドドーマント（MD）、休眠（D）、および中活性段階（MA）段階で研究されました。老いも若きも。発達は、季節の変動や品種の種類よりも遺伝子発現に影響を与えるようです。さらに、詳細な転写および代謝産物プロファイリングは、f3'h、f3'5'h、fls、dfr、lar、anr、ansのカテキン生合成などの遺伝子を特定しました。開発中の規制当局と3つの異なる茶栽培品種間の季節変動。さらに、ABA、GA、エチレン、オーキシンなどの植物ホルモンに関連する遺伝子の発現分析は、茶栽培品種の季節変動中の発達組織における役割を示唆しています。さらに、ヒストンとDNAの修飾に関与する遺伝子の微分発現は、茶の発生および季節変動中のグローバルな遺伝子発現を調整する際のエピジェネティックなメカニズムの役割をさらに示唆しています。私たちの調査結果は、茶の発達と季節変動に関連するグローバルな転写再プログラムに関する洞察を提供します。

Tea quality and yield is influenced by various factors including developmental tissue, seasonal variation and cultivar type. Here, the molecular basis of these factors was investigated in three tea cultivars namely, Him Sphurti (H), TV23 (T), and UPASI-9 (U) using RNA-seq. Seasonal variation in these cultivars was studied during active (A), mid-dormant (MD), dormant (D) and mid-active (MA) stages in two developmental tissues viz. young and old leaf. Development appears to affect gene expression more than the seasonal variation and cultivar types. Further, detailed transcript and metabolite profiling has identified genes such as F3'H, F3'5'H, FLS, DFR, LAR, ANR and ANS of catechin biosynthesis, while MXMT, SAMS, TCS and XDH of caffeine biosynthesis/catabolism as key regulators during development and seasonal variation among three different tea cultivars. In addition, expression analysis of genes related to phytohormones such as ABA, GA, ethylene and auxin has suggested their role in developmental tissues during seasonal variation in tea cultivars. Moreover, differential expression of genes involved in histone and DNA modification further suggests role of epigenetic mechanism in coordinating global gene expression during developmental and seasonal variation in tea. Our findings provide insights into global transcriptional reprogramming associated with development and seasonal variation in tea.