ハイスループットT細胞受容体シーケンスは、HBV関連HCCの腫瘍と隣接する非腫瘍組織との間の明確なレパートリーを明らかにします

特定のT細胞受容体（TCR）を介して抗原ペプチドを認識するTリンパ球は、ヒト適応免疫応答に重要な役割を果たします。TCRの多様性は、宿主の免疫反応と癌予後と密接に関連しています。腫瘍浸潤Tリンパ球は腫瘍予後に影響を及ぼしますが、B型肝炎ウイルス（HBV）関連肝細胞癌（HCC）の腫瘍組織と非腫瘍組織の両方でTCR多様性の詳細な特性を実施した研究はほとんどありません。ここでは、48のHBV関連HCC患者から肝臓浸潤T細胞の領域3（CDR3）を決定するTCRβ鎖相補性を決定するTCRβ鎖相補性のハイスループットシーケンスを実行しました。CDR3 AAクロノタイプの平均数が有意に高い（2259対1324、p <0.001）、および大幅に高いTCR多様性（Gini係数、P <0.001; Simpsonインデックス、P <0.01;シャノンエントロピー、P <0.001）が観察されました。隣接する非腫瘍組織と比較した腫瘍組織。HEC閾値が2％以上として定義された場合、高度に拡張されたクローン（HECS）の比率は、腫瘍組織よりも非腫瘍組織の方が有意に高かった（P <0.05）。モリシタホーン指数の中央値の分析は、腫瘍と一致した非腫瘍組織の間のTCRレパートリーの類似性が弱いことを示しています。腫瘍組織の共有クローンの中央値数と各患者の非腫瘍組織の一致は360.5で、各患者のすべてのクローンの5.1-15.8％（10.6±0.4％）を表しています。HCC患者の隣接する非腫瘍組織では、腫瘍におけるTリンパ球の広範な不均一性とHEC比が高いことが観察されました。腫瘍および非腫瘍組織の微分T細胞レパートリーは、HBV関連HCC患者の異なるT細胞免疫微小環境を示唆しています。

T lymphocytes, which recognize antigen peptides through specific T cell receptors (TCRs), play an important role in the human adaptive immune response. TCR diversity is closely associated with host immune response and cancer prognosis. Although tumor-infiltrating T lymphocytes have implications for tumor prognosis, few studies have performed a detailed characterization of TCR diversity in both tumor and non-tumor tissues in hepatitis B virus (HBV)-associated hepatocellular carcinoma (HCC). Here, we performed high-throughput sequencing of the TCRβ chain complementarity determining region 3 (CDR3) of liver-infiltrating T cells from 48 HBV-associated HCC patients. A significantly higher average number of CDR3 aa clonotypes (2259 vs. 1324, p < 0.001), and significantly higher TCR diversity (Gini coefficient, p < 0.001; Simpson index, p < 0.01; Shannon entropy, p < 0.001) were observed in tumor tissues compared with adjacent non-tumor tissues. The ratio of highly expanded clones (HECs) was significantly higher in non-tumor tissues than in tumor tissues when the HEC threshold was defined as 2% or greater (p < 0.05). Our analysis of the median Morisita-Horn index indicated weak TCR repertoire similarity between tumor and matched non-tumor tissues. The median number of shared clones in tumor tissue and matched non-tumor tissue from each patient was 360.5, representing 5.1-15.8% (10.6 ± 0.4%) of all clones in each patient. We observed extensive heterogeneity of T lymphocytes in tumors and higher HEC ratios in adjacent non-tumor tissues of HCC patients. The differential T cell repertoires in tumor and non-tumor tissues suggest a distinct T cell immune microenvironment in patients with HBV-associated HCC.