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目的:この研究の目標は、健康なコントロールと比較して、軽度の認知障害(MCI)およびアルツハイマー病(AD)の個人から収集された脳脊髄液(CSF)の推定分子動的変化を調査することです。 実験設計:それぞれ4人の認知的に正常な個人とMCIおよびADの8人の患者で構成される12人の被験者からのCSFサンプル。各参加者の各CSFサンプル(合計1 mL)の2つのアリコートがこの研究に使用されます。内因性ペプチド分離は、10 000分子量カットオフフィルターに続いてLC-MS/MSの識別と定量化を使用して実行されますが、レクチン濃縮クロマトグラフィーを使用してCSFの糖タンパク質を濃縮し、その後のトリプシン消化とその後のLC-MS/MSがショットガンの識別とラベルフリーの量子化を濃縮します。 結果:分子量のカットオフろ過と家で構成されたデータベースで最適化されたサブミクラムペプチド分離を使用して、645ペプチドが識別されます。糖タンパク質はレクチンアフィニティクロマトグラフィーによって濃縮され、795件の特定されたタンパク質が生じます。Prosaas由来のペプチドとトランスサイレチンの発見と変化について説明し、ADでのその役割について説明します。 結論と臨床的関連性:内因性CSFペプチドームの包括的な識別が達成されます。15のタンパク質は、3つのグループ間で差別的に発現することがわかっています。トランスシレチンの動的変化が初めて報告されます。
目的:この研究の目標は、健康なコントロールと比較して、軽度の認知障害(MCI)およびアルツハイマー病(AD)の個人から収集された脳脊髄液(CSF)の推定分子動的変化を調査することです。 実験設計:それぞれ4人の認知的に正常な個人とMCIおよびADの8人の患者で構成される12人の被験者からのCSFサンプル。各参加者の各CSFサンプル(合計1 mL)の2つのアリコートがこの研究に使用されます。内因性ペプチド分離は、10 000分子量カットオフフィルターに続いてLC-MS/MSの識別と定量化を使用して実行されますが、レクチン濃縮クロマトグラフィーを使用してCSFの糖タンパク質を濃縮し、その後のトリプシン消化とその後のLC-MS/MSがショットガンの識別とラベルフリーの量子化を濃縮します。 結果:分子量のカットオフろ過と家で構成されたデータベースで最適化されたサブミクラムペプチド分離を使用して、645ペプチドが識別されます。糖タンパク質はレクチンアフィニティクロマトグラフィーによって濃縮され、795件の特定されたタンパク質が生じます。Prosaas由来のペプチドとトランスサイレチンの発見と変化について説明し、ADでのその役割について説明します。 結論と臨床的関連性:内因性CSFペプチドームの包括的な識別が達成されます。15のタンパク質は、3つのグループ間で差別的に発現することがわかっています。トランスシレチンの動的変化が初めて報告されます。
PURPOSE: The goal of this study is to investigate putative molecular dynamic changes in cerebrospinal fluids (CSFs) collected from individuals with mild cognitive impairment (MCI) and Alzheimer's disease (AD) as compared to healthy controls. EXPERIMENTAL DESIGN: The CSF samples from 12 subjects comprised of four cognitively normal individuals and eight patients with MCI and AD, respectively. Two aliquots of each CSF samples (total 1 mL) of each participant are used for this study. Endogenous peptide separations are performed using 10 000 molecular weight cut-off filters followed by LC-MS/MS identification and quantitation while lectin-enrichment chromatography is used to enrich glycoproteins in CSF followed by trypsin digestion and subsequent LC-MS/MS for shotgun identification and label-free quantitation. RESULTS: Using an optimized submicrogram peptide separation with molecular weight cut-off filtration and an in house-constructed database, 645 peptides are identified. Glycoproteins are enriched by lectin affinity chromatography, resulting in 795 identified proteins. The discovery and alterations of proSAAS-derived peptides and transthyretin are described and their roles in AD are discussed. CONCLUSIONS AND CLINICAL RELEVANCE: Comprehensive identification of endogenous CSF peptidome is achieved. Fifteen proteins are found to be differentially expressed among the three groups. The dynamic changes of transthyretin are reported for the first time.
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