ImageJプラグインを使用したセルカウント手順の自動定量化と分析

国立衛生研究所のImageJは、強力で自由に利用可能な画像処理ソフトウェアスイートです。ImageJには、さまざまな生物学的粒子をカウントするために効果的に使用できる包括的な粒子分析アルゴリズムがあります。多数の細胞サンプルを数えると、血球計は時に順調にボトルネックを提示します。同様に、ImageJプラグインセルカウンターを使用した移動/侵入アッセイからの膜をカウントすることは、正確ではありますが、手首の痛みを引き起こすために非常に労働集約的で、主観的で、悪名高いものです。このニーズに対処するために、自動化された血球計（または既知の体積）と移動/浸潤細胞カウントの唯一のタスクのために、ImageJ内に2つのプラグインを開発しました。両方のプラグインは、背景を最小限に抑えて高品質の顕微鏡写真を取得する機能に依存しています。それらは使いやすく、カウントのキャリブレーションを支援する組み込みの分析ツールを備えた大きなサンプルサイズの迅速なカウントと分析のために最適化されています。セルカウンターのコア原理を自動カウントアルゴリズムとポストカウント分析と組み合わせることにより、精度を失うことなく移動アッセイを処理できる容易さが大幅に増加します。

The National Institute of Health's ImageJ is a powerful, freely available image processing software suite. ImageJ has comprehensive particle analysis algorithms which can be used effectively to count various biological particles. When counting large numbers of cell samples, the hemocytometer presents a bottleneck with regards to time. Likewise, counting membranes from migration/invasion assays with the ImageJ plugin Cell Counter, although accurate, is exceptionally labor intensive, subjective, and infamous for causing wrist pain. To address this need, we developed two plugins within ImageJ for the sole task of automated hemocytometer (or known volume) and migration/invasion cell counting. Both plugins rely on the ability to acquire high quality micrographs with minimal background. They are easy to use and optimized for quick counting and analysis of large sample sizes with built-in analysis tools to help calibration of counts. By combining the core principles of Cell Counter with an automated counting algorithm and post-counting analysis, this greatly increases the ease with which migration assays can be processed without any loss of accuracy.