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背景：統合失調症の不均一な性質のため、疾患の遺伝的リスクを理解することは複雑な作業です。遺伝子発現研究は、組織固有の方法で一貫して複製されているため、関連研究よりも信頼性が高いことが証明されています。 方法：RNA-seqを使用して、統合失調症と25人の影響を受けていないコントロールを持つ24人の個人の前頭皮質における遺伝子発現を分析しました。 結果：統合失調症で差次的に発現した1146個の遺伝子を特定しました。その約60％はアップレギュレートされ、1146の366（32％）も異常なDNAメチル化を持っています（P = 2.46×10-39）。差次的に発現した遺伝子は、炎症（p = 8.7×10-3）および一酸化窒素経路（p = 9.2×10-4）を含むいくつかの経路で有意に過剰に表現されました。さらに、これらの遺伝子は、ドラッグ可能なゲノムを持つ患者のために有意に濃縮されました（P = 0.04）。異なる脳組織を使用して他の遺伝子発現研究で確認されているように、統合失調症で有意にアップレギュレートされた多くの遺伝子を特定しました。精神医学ゲノミクスコンソーシアムの統合失調症に関連する349の遺伝子のうち、差次的に発現した遺伝子のリストから重要な16の遺伝子を特定しました。 結論：我々の結果は、統合失調症で示差的に発現する生物学的機能遺伝子を特定しました。これらの遺伝子のサブセットは、臨床的に証明された薬物標的です。また、統合失調症の根本的な欠陥を反映する可能性のある差次的に発現した免疫応答遺伝子の強いパターンを発見しました。
背景：統合失調症の不均一な性質のため、疾患の遺伝的リスクを理解することは複雑な作業です。遺伝子発現研究は、組織固有の方法で一貫して複製されているため、関連研究よりも信頼性が高いことが証明されています。 方法：RNA-seqを使用して、統合失調症と25人の影響を受けていないコントロールを持つ24人の個人の前頭皮質における遺伝子発現を分析しました。 結果：統合失調症で差次的に発現した1146個の遺伝子を特定しました。その約60％はアップレギュレートされ、1146の366（32％）も異常なDNAメチル化を持っています（P = 2.46×10-39）。差次的に発現した遺伝子は、炎症（p = 8.7×10-3）および一酸化窒素経路（p = 9.2×10-4）を含むいくつかの経路で有意に過剰に表現されました。さらに、これらの遺伝子は、ドラッグ可能なゲノムを持つ患者のために有意に濃縮されました（P = 0.04）。異なる脳組織を使用して他の遺伝子発現研究で確認されているように、統合失調症で有意にアップレギュレートされた多くの遺伝子を特定しました。精神医学ゲノミクスコンソーシアムの統合失調症に関連する349の遺伝子のうち、差次的に発現した遺伝子のリストから重要な16の遺伝子を特定しました。 結論：我々の結果は、統合失調症で示差的に発現する生物学的機能遺伝子を特定しました。これらの遺伝子のサブセットは、臨床的に証明された薬物標的です。また、統合失調症の根本的な欠陥を反映する可能性のある差次的に発現した免疫応答遺伝子の強いパターンを発見しました。
BACKGROUND: Due to the heterogeneous nature of schizophrenia, understanding the genetic risk for the disease is a complex task. Gene expression studies have proven to be more reliable than association studies as they are consistently replicated in a tissue specific manner. METHODS: Using RNA-Seq we analysed gene expression in the frontal cortex of 24 individuals with schizophrenia and 25 unaffected controls. RESULTS: We identified 1146 genes that were differentially expressed in schizophrenia, approximately 60% of which were up-regulated and 366 of 1146 (32%) also have aberrant DNA methylation (p=2.46×10-39). The differentially expressed genes were significantly overrepresented in several pathways including inflammatory (p=8.7×10-3) and nitric oxide pathways (p=9.2×10-4). Moreover, these genes were significantly enriched for those with a druggable genome (p=0.04). We identified a number of genes that are significantly up-regulated in schizophrenia as confirmed in other gene expression studies using different brain tissues. Of the 349 genes associated with schizophrenia from the Psychiatric Genomics Consortium we identified 16 genes that are significant from our list of differentially expressed genes. CONCLUSIONS: Our results identified biological functional genes that are differentially expressed in schizophrenia. A subset of these genes are clinically proven drug targets. We also found a strong pattern of differentially expressed immune response genes that may reflect an underlying defect in schizophrenia.
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