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個体発生中、胎児肝臓（FL）は造血幹細胞（HSC）の成熟と拡張の主要な部位として作用しますが、成体の骨髄（ABM）のHSCはほとんど静止しています。FLのHSCは、ABM HSCと比較して、より速い再硬化能力を備えています。ただし、FL HSCのより大きな自己再生ポテンシャルを調節する分子メカニズムは、まだ広範囲に評価されていません。最近、ABM HSCと比較して、14.5日間のマウス胚（E14.5）のFL HSCに関するRNAシーケンスベースの遺伝子発現分析を公開しました。これらのデータを再分析して、開発中のHSCの拡大において重要な役割を果たす重要な転写調節因子を特定しました。FL E14.5とABM HSCの比較により、1,400を超える差別的に発現した遺伝子が特定されました。遺伝子オントロジー（GO）注釈用語「転写」に基づいて、200を超える遺伝子が最終候補になりました。ゼブラフィッシュのモルホリノベースのノックダウン研究により、以前はHSC増殖に関連していなかったこれらの調節因子のうち18の機能を評価しました。我々の研究では、ゼブラフィッシュの決定的な造血の出現におけるTDG、UHRF1、UCHL5、およびNCOA1の以前は未知の役割を特定しました。結論として、拡張FL HSCと静止ABM HSCの間で異なる発現した転写調節に関与する遺伝子の同定が、HSC機能の新規調節因子を明らかにすることを実証します。
個体発生中、胎児肝臓（FL）は造血幹細胞（HSC）の成熟と拡張の主要な部位として作用しますが、成体の骨髄（ABM）のHSCはほとんど静止しています。FLのHSCは、ABM HSCと比較して、より速い再硬化能力を備えています。ただし、FL HSCのより大きな自己再生ポテンシャルを調節する分子メカニズムは、まだ広範囲に評価されていません。最近、ABM HSCと比較して、14.5日間のマウス胚（E14.5）のFL HSCに関するRNAシーケンスベースの遺伝子発現分析を公開しました。これらのデータを再分析して、開発中のHSCの拡大において重要な役割を果たす重要な転写調節因子を特定しました。FL E14.5とABM HSCの比較により、1,400を超える差別的に発現した遺伝子が特定されました。遺伝子オントロジー（GO）注釈用語「転写」に基づいて、200を超える遺伝子が最終候補になりました。ゼブラフィッシュのモルホリノベースのノックダウン研究により、以前はHSC増殖に関連していなかったこれらの調節因子のうち18の機能を評価しました。我々の研究では、ゼブラフィッシュの決定的な造血の出現におけるTDG、UHRF1、UCHL5、およびNCOA1の以前は未知の役割を特定しました。結論として、拡張FL HSCと静止ABM HSCの間で異なる発現した転写調節に関与する遺伝子の同定が、HSC機能の新規調節因子を明らかにすることを実証します。
During ontogeny, fetal liver (FL) acts as a major site for hematopoietic stem cell (HSC) maturation and expansion, whereas HSCs in the adult bone marrow (ABM) are largely quiescent. HSCs in the FL possess faster repopulation capacity as compared with ABM HSCs. However, the molecular mechanism regulating the greater self-renewal potential of FL HSCs has not yet extensively been assessed. Recently, we published RNA sequencing-based gene expression analysis on FL HSCs from 14.5-day mouse embryo (E14.5) in comparison to the ABM HSCs. We reanalyzed these data to identify key transcriptional regulators that play important roles in the expansion of HSCs during development. The comparison of FL E14.5 with ABM HSCs identified more than 1,400 differentially expressed genes. More than 200 genes were shortlisted based on the gene ontology (GO) annotation term "transcription." By morpholino-based knockdown studies in zebrafish, we assessed the function of 18 of these regulators, previously not associated with HSC proliferation. Our studies identified a previously unknown role for tdg, uhrf1, uchl5, and ncoa1 in the emergence of definitive hematopoiesis in zebrafish. In conclusion, we demonstrate that identification of genes involved in transcriptional regulation differentially expressed between expanding FL HSCs and quiescent ABM HSCs, uncovers novel regulators of HSC function.
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