siRNAによるプロモーター関連RNAをターゲットにします

プロモーター関連RNA（PARNA）は、他の遺伝子のプロモーターの対応において、意味またはアンチセンス方向に転写される長い非コードRNAです。それらの発現は、特定の調節機能によってプロモーター活性に影響します。PARNAは、クロマチンのリモデリングまたは転写として、遺伝子発現を調節するプロセスに関与するタンパク質の足場として作用することができます。RNA誘導転写サイレンシング（RITS）は、パルナとしてクロマチン関連RNAに向けられたsiRNAによって達成される転写干渉のメカニズムです。この章では、細胞核におけるsiRNAとPARNAの間の相互作用を検出し、siRNA能力を調査してPARNAタンパク質複合体を不安定にする方法について説明します。

Promoter-associated RNAs (paRNA) are long noncoding RNAs transcribed in sense or antisense direction in correspondence of promoters of other genes. Their expression influences promoter activity by means of specific regulatory function. PaRNA can act as a scaffold for proteins involved in processes regulating gene expression, as chromatin remodeling or transcription. RNA-induced transcriptional silencing (RITS) is the mechanism of transcriptional interference achieved by siRNA directed against chromatin-associated RNAs, as paRNAs. In this chapter, it is described how to detect interaction between siRNA and paRNA in cell nuclei and investigate siRNA capability to destabilize paRNA-protein complex.