乳がんにおけるCD47関連のスーパーエンハンサーリンク炎症性シグナル伝達は、CD47アップレギュレーションにリンクします

CD47は、マクロファージおよびその他の免疫細胞上の受容体であるSIRPαに結合することでそれを発現する細胞の食作用を阻害する細胞表面分子です。CD47は、腫瘍性および正常細胞によって異なるレベルで発現します。ここでは、異なる腫瘍細胞がこの支配的な「Eat Me」シグナルを生成するメカニズムを明らかにするために、CD47調節のゲノム環境を分析します。特定の癌細胞タイプでCD47に関連する2つの異なるスーパーエンハンサー（SES）を特定します。2つのCD47 SES内に位置する一連のアクティブ成分エンハンサーが、異なる癌細胞タイプでCD47発現を調節し、CD47 SESの破壊がCD47遺伝子発現を減少させることを示しています。最後に、TNF-NFKB1シグナル伝達経路は、乳がんに特異的なCD47関連SE内にある構成エンハンサーと相互作用することにより、CD47を直接調節することを報告します。これらの結果は、癌を進化させてCD47の過剰発現を駆動して免疫監視を逃れることができることを示唆しています。

CD47 is a cell surface molecule that inhibits phagocytosis of cells that express it by binding to its receptor, SIRPα, on macrophages and other immune cells. CD47 is expressed at different levels by neoplastic and normal cells. Here, to reveal mechanisms by which different neoplastic cells generate this dominant 'don't eat me' signal, we analyse the CD47 regulatory genomic landscape. We identify two distinct super-enhancers (SEs) associated with CD47 in certain cancer cell types. We show that a set of active constituent enhancers, located within the two CD47 SEs, regulate CD47 expression in different cancer cell types and that disruption of CD47 SEs reduces CD47 gene expression. Finally we report that the TNF-NFKB1 signalling pathway directly regulates CD47 by interacting with a constituent enhancer located within a CD47-associated SE specific to breast cancer. These results suggest that cancers can evolve SE to drive CD47 overexpression to escape immune surveillance.