SNCA 3'utrパーキンソン病およびレム睡眠行動障害の患者における遺伝的変異

レム睡眠行動障害（RBD）は、パーキンソン病（PD）の初期マーカーです。ただし、どのRBD患者が最終的にPDを発症するかはまだ不明です。アルファシヌクレイン（SNCA）の3'Untranslated領域（3'UTR）の単一ヌクレオチド多型（SNP）はPDに関連していますが、現在、RBDに関するデータは利用できません。3'utrは、microRNA結合部位などの遺伝子発現制御に関与する調節領域をホストします。この研究の目的は、「特発性」RBD（IRBD）患者およびPD患者のSNCA-3'UTRのシーケンスにより、PDへの進行リスクの増加に関連するRBD特異的遺伝的特徴を決定することでした。IRBD（56人の患者）またはPD（RBDの有無にかかわらず、57人の患者）と診断された113人の連続した患者を募集しました。SNCA-3'UTRのシーケンスは、末梢血サンプルから抽出されたゲノムDNAに対して行われました。同定された遺伝的変異体がmicroRNA結合に及ぼす潜在的な効果を予測するために、バイオインフォマティック分析を実施しました。3つのSNCA-3'UTR SNP（RS356165、RS3857053、RS1045722）がIRBD患者よりもPD患者の方が頻繁であることがわかりました（それぞれP = 0.014、0.008、および0.008）。4つの新規または以前に報告されていますが、注釈付きの特定の遺伝的変異体（KP876057、KP876056、NM_000345.3：C*860T> A、NM_000345.3：C*2320A> t）がRBD集団で観察されました。In Silicoアプローチは、これらのバリアントがマイクロRNAを介した遺伝子発現制御に影響を与える可能性があることを強調しました。私たちのデータは、RBDがPDに関連するリスクを負う可能性のあるSNCA-3'utrの特定のSNPを示しています。さらに、IRBD患者で新しい遺伝的変異が特定されました。

REM sleep behavior disorder (RBD) is an early marker of Parkinson's disease (PD); however, it is still unclear which patients with RBD will eventually develop PD. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 3'untranslated region (3'UTR) of alpha-synuclein (SNCA) have been associated with PD, but at present, no data is available about RBD. The 3'UTR hosts regulatory regions involved in gene expression control, such as microRNA binding sites. The aim of this study was to determine RBD specific genetic features associated to an increased risk of progression to PD, by sequencing of the SNCA-3'UTR in patients with "idiopathic" RBD (iRBD) and in patients with PD. We recruited 113 consecutive patients with a diagnosis of iRBD (56 patients) or PD (with or without RBD, 57 patients). Sequencing of SNCA-3'UTR was performed on genomic DNA extracted from peripheral blood samples. Bioinformatic analyses were carried out to predict the potential effect of the identified genetic variants on microRNA binding. We found three SNCA-3'UTR SNPs (rs356165, rs3857053, rs1045722) to be more frequent in PD patients than in iRBD patients (p = 0.014, 0.008, and 0.008, respectively). Four new or previously reported but not annotated specific genetic variants (KP876057, KP876056, NM_000345.3:c*860T>A, NM_000345.3:c*2320A>T) have been observed in the RBD population. The in silico approach highlighted that these variants could affect microRNA-mediated gene expression control. Our data show specific SNPs in the SNCA-3'UTR that may bear a risk for RBD to be associated with PD. Moreover, new genetic variants were identified in patients with iRBD.