更新世の堆積物からのネアンデルタルおよびデニソバンDNA

更新世のヒト関連の考古学的集合体の豊富な記録が存在しますが、人類の化石の希少性はしばしば、どのホミニンがサイトを占領したかについての理解を妨げます。ミトコンドリアDNAの標的濃縮を使用して、洞窟堆積物は、しばしば人類のDNAの痕跡を含む古代哺乳類DNAの豊富な供給源であることを示しています。多数の堆積物サンプルの自動支援スクリーニングにより、ユーラシアの4つの洞窟から8つの考古学的層でネアンデルタルDNAを検出しました。デニソワ洞窟では、層序の底近くの更新世中期の層でデニソヴァンDNAを回収しました。私たちの作品は、骨格の遺跡が見つからないサイトや地域でのヒモ系グループの存在を検出する可能性を開きます。

Although a rich record of Pleistocene human-associated archaeological assemblages exists, the scarcity of hominin fossils often impedes the understanding of which hominins occupied a site. Using targeted enrichment of mitochondrial DNA, we show that cave sediments represent a rich source of ancient mammalian DNA that often includes traces of hominin DNA, even at sites and in layers where no hominin remains have been discovered. By automation-assisted screening of numerous sediment samples, we detected Neandertal DNA in eight archaeological layers from four caves in Eurasia. In Denisova Cave, we retrieved Denisovan DNA in a Middle Pleistocene layer near the bottom of the stratigraphy. Our work opens the possibility of detecting the presence of hominin groups at sites and in areas where no skeletal remains are found.