歴史的移行を伴う家畜飼育の繁殖プログラムにおける対立する目的を考慮して、新しい最適な貢献選択方法

背景：Optimum貢献選択（OCS）は、遺伝的ゲインの増加に効果的であり、近親交配の速度を制御し、遺伝的多様性の維持を可能にします。ただし、この多様性は、他の品種からの遺伝物質の遺伝性の遺伝性により、人口の高い移民貢献（MC）によって引き起こされる可能性があり、小さな地元の個体群の保存を脅かす可能性があります。したがって、繁殖の目的は、遺伝的利益の増加だけでなく、遺伝的独創性と在来対立遺伝子の多様性の維持にも焦点を当てる必要があります。この研究の目的は、OCSがMCと、対立遺伝子の品種起源を説明する修正された親族関係を含めることで改善されたかどうかを調査することを目的としています。親族関係を最小限に抑え、MCを最小限に抑え、子孫の遺伝的増加を最大化するために、3つの目的機能が考慮され、ドイツの釣り人とVorderwald牛に対する影響を調査しました。 結果：ほとんどのシナリオでは、結果は釣り人とヴォーダーヴァルト牛について類似していた。MCと選択候補の推定された繁殖値との間の有意な正の相関が両方の品種で観察されたため、従来のOCはMCを増加させます。近親交配率は1％を超えず、他のすべての基準で最大進捗の少なくとも30％が達成されたという条件の下で最適化が実行されました。従来のOCは、古典的な親族の制限下で最高の繁殖値を提供しましたが、子孫の世代におけるMCの大きさは制御されていませんでした。MCが制約または最小化された場合、ネイティブアレルの親族は参照シナリオと比較して増加しました。したがって、MCの制約に加えて、在来の遺伝的多様性が維持されることを確認するために、ネイティブ対立遺伝子での親族関係を制約する必要があります。ネイティブアレルの親族関係が制約されたとき、ほとんどの場合、古典的な親族は自動的に低下し、より多くのsireが選択されました。ただし、次世代の平均繁殖値も、従来のOCで得られたものよりも低かった。 結論：歴史的内容を伴う局所品種の場合、現在の繁殖プログラムは、遺伝的ゲインの増加と近親交配の制御、および品種の遺伝的独創性と在来対立遺伝子の多様性を維持することに焦点を当てる必要があります。OCSプロセス。

BACKGROUND: Optimum contribution selection (OCS) is effective for increasing genetic gain, controlling the rate of inbreeding and enables maintenance of genetic diversity. However, this diversity may be caused by high migrant contributions (MC) in the population due to introgression of genetic material from other breeds, which can threaten the conservation of small local populations. Therefore, breeding objectives should not only focus on increasing genetic gains but also on maintaining genetic originality and diversity of native alleles. This study aimed at investigating whether OCS was improved by including MC and modified kinships that account for breed origin of alleles. Three objective functions were considered for minimizing kinship, minimizing MC and maximizing genetic gain in the offspring generation, and we investigated their effects on German Angler and Vorderwald cattle. RESULTS: In most scenarios, the results were similar for Angler and Vorderwald cattle. A significant positive correlation between MC and estimated breeding values of the selection candidates was observed for both breeds, thus traditional OCS would increase MC. Optimization was performed under the condition that the rate of inbreeding did not exceed 1% and at least 30% of the maximum progress was achieved for all other criteria. Although traditional OCS provided the highest breeding values under restriction of classical kinship, the magnitude of MC in the progeny generation was not controlled. When MC were constrained or minimized, the kinship at native alleles increased compared to the reference scenario. Thus, in addition to constraining MC, constraining kinship at native alleles is required to ensure that native genetic diversity is maintained. When kinship at native alleles was constrained, the classical kinship was automatically lowered in most cases and more sires were selected. However, the average breeding value in the next generation was also lower than that obtained with traditional OCS. CONCLUSIONS: For local breeds with historical introgressions, current breeding programs should focus on increasing genetic gain and controlling inbreeding, as well as maintaining the genetic originality of the breeds and the diversity of native alleles via the inclusion of MC and kinship at native alleles in the OCS process.