非系統型サルモネラの集団における明確な多剤耐性表現型の出現と普及に対する家畜環境の強い影響

特にグラム陰性菌の間で、多剤耐性の出現と普及の問題は、驚くべきレベルに達しました。これにより、多剤耐性生物の出現と拡散に関する情報をより効果的かつ正確に提供する監視方法を開発する必要性が高まります。この研究では、鳥類、ウシ、ブタの宿主に関連する非定量的なサルモネラ（NTS）分離株の明確な集団を使用して、家畜環境には特定の（P <0.005）および深い（P <0.005）効果があることがわかりました。NTS分離株の集団における多剤耐性表現型の進化について。ペニシリン、テトラサイクリンおよびマクロライドを含むMDRパターン、および進化するカウンターパート（すなわち、ペニシリン、テトラサイクリン、マクロライド +その他の抗生物質クラス）は、ポリシン起源のNTS分離株に関連する（P <0.005）。同様に、葉酸経路阻害剤、マクロリド、アミノサイクリトール、またはペニシリン、セファロスポリン、テトラサイクリン、フェニコール、マクロライドを含むMDRパターンは、それぞれ鳥（p <0.005）およびウシ（p <0.005）NTS分離と有意に関連していました。さらに、進化的分析である構造は、異なるNTS血清型の遺伝的背景ではなく、宿主の起源（すなわち、家畜環境）がMDR表現型の獲得と拡散の最も決定的な要因であることを明確に示しました。さらに、フルオロキノロン耐性に関連する可能性が高いGyraの位置864のQRDRの外側にある新規の非同義突然変異について説明しました。

The problem of emergence and dissemination of multidrug resistance, especially among Gram-negative bacteria, has reached alarming levels. This increases the need to develop surveillance methods that more effectively and accurately provide information about the emergence and spread of multidrug-resistant organisms. In this study, using a well-defined population of non-typhoidal Salmonella (NTS) isolates associated with avian, bovine and porcine hosts, we found that the livestock environments had a specific (P < 0.005) and profound (P < 0.005) effect on the evolution of multidrug-resistant phenotypes among population of NTS isolates. The MDR pattern containing penicillins, tetracyclines and macrolides and the evolving counterparts (i.e., penicillins, tetracyclines and macrolides + other antibiotic classes) were significantly (P < 0.005) associated with NTS isolates of porcine origin. Similarly, MDR patterns containing folate pathway inhibitors, macrolides and aminocyclitol or containing penicillins, cephalosporins, tetracyclines, phenicols and macrolides were significantly associated with avian (P < 0.005) and bovine (P < 0.005) NTS isolates, respectively. Furthermore, STRUCTURE, an evolutionary analysis, clearly showed that the host origin (i.e., livestock environment), and not the genetic background of different NTS serovars, was the most determinative factor for acquisition and spread of MDR phenotypes. In addition, we described a novel non-synonymous mutation, located outside of the QRDR at position 864 of GyrA, that was likely associated with fluoroquinolone resistance.