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難聴(HL)は、広範囲にわたる社会的、心理的、認知的意味を持つ先進国で最も一般的な先天異常です。それは非常に不均一な疾患であり、分子検査を複雑にしています。次世代シーケンス(NGS)の導入により、診断が大きな進歩を遂げ、すべての既知のHL遺伝子を単一のアッセイで研究できるようになりました。診断利回りは現在まだ限られていますが、大幅に増加する可能性があります。対象領域:このレビューでは、NGSの有用性とHLの包括的な分子試験の問題について評価および議論します。専門家の解説:さまざまな出版物が、HLなどの不均一疾患の分子検査に対するNGSの適切性を証明しています。ただし、いくつかの遺伝子の偽遺伝子形成の背景や、ターゲットを絞ったNGSデータの問題のあるコピー数のバリアント分析など、いくつかの問題が存在します。将来のもう1つの主な課題は、HLの正確なパーソナライズされた包括的な分子試験を実現するための集団固有の突然変異スペクトルの確立です。
難聴(HL)は、広範囲にわたる社会的、心理的、認知的意味を持つ先進国で最も一般的な先天異常です。それは非常に不均一な疾患であり、分子検査を複雑にしています。次世代シーケンス(NGS)の導入により、診断が大きな進歩を遂げ、すべての既知のHL遺伝子を単一のアッセイで研究できるようになりました。診断利回りは現在まだ限られていますが、大幅に増加する可能性があります。対象領域:このレビューでは、NGSの有用性とHLの包括的な分子試験の問題について評価および議論します。専門家の解説:さまざまな出版物が、HLなどの不均一疾患の分子検査に対するNGSの適切性を証明しています。ただし、いくつかの遺伝子の偽遺伝子形成の背景や、ターゲットを絞ったNGSデータの問題のあるコピー数のバリアント分析など、いくつかの問題が存在します。将来のもう1つの主な課題は、HLの正確なパーソナライズされた包括的な分子試験を実現するための集団固有の突然変異スペクトルの確立です。
Hearing loss (HL) is the most common birth defect in industrialized countries with far-reaching social, psychological and cognitive implications. It is an extremely heterogeneous disease, complicating molecular testing. The introduction of next-generation sequencing (NGS) has resulted in great progress in diagnostics allowing to study all known HL genes in a single assay. The diagnostic yield is currently still limited, but has the potential to increase substantially. Areas covered: In this review the utility of NGS and the problems for comprehensive molecular testing for HL are evaluated and discussed. Expert commentary: Different publications have proven the appropriateness of NGS for molecular testing of heterogeneous diseases such as HL. However, several problems still exist, such as pseudogenic background of some genes and problematic copy number variant analysis on targeted NGS data. Another main challenge for the future will be the establishment of population specific mutation-spectra to achieve accurate personalized comprehensive molecular testing for HL.
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