PAN-TRK免疫組織化学は、NTRK融合を検出するための効率的で信頼できるスクリーンです

核酸ベースのアッセイを使用して通常検出される神経栄養チロシン受容体キナーゼ（NTRK）融合を活性化することは、非常に標的になり、特定の腫瘍を定義します。ここでは、Pan-TRK免疫組織化学（IHC）の有用性を調査して、NTRK融合を検出します。NTRKの再配列は、DNAベースの次世代シーケンスアッセイであるMSKインパクトを使用して前向きに検出されました。潜在的に機能的な融合転写産物への新規NTRK再配置の転写は、Archer DX融合アッセイを介して評価されました。MAB EPR17341を使用したPAN-TRK IHCテストは、すべてのNTRK再配置されたケースで実行され、アーチャーのNTRK融合については20症例が負でした。NTRKの再配置を伴う23症例のうち、15症例が活性化融合を知っていました。Archerは、不確実な機能的有意性の8つの新規NTRK再配置のうち6つで融合転写産物を検出しました。PAN-TRK IHCは、Archerによって確認されたNTRK融合転写産物の21症例のうち20症例で陽性でした。不一致の陰性症例は、ETV6-NTRK3融合を伴う不粘性修復不足と結腸直腸癌でした。20の追加の射手陰性症例はすべて、一致するパンTRK IHCの結果がありました。転写されたNTRK融合のPAN-TRK IHCの感度と特異性は、それぞれ95.2％と100％でした。すべての正のIHC症例には細胞質染色があり、次の融合パートナー特異的パターンが発見されました。すべての5つのLMNA-NTRK1融合が核膜のアクセントを示し、4つのTPM3/4融合すべてが細胞膜のアクセント化を示し、半分（3/6）がETV6-の半分（3/6）を示しました。Ntrk3融合は核染色を示しました。PAN-TRK IHCは、特にドライバーネガティブな高度な悪性腫瘍および分泌癌および先天性線維肉腫の潜在的な症例において、NTRK融合の時間効率が高く組織効率の高いスクリーニングです。Pan-TRK IHCは、新しいNTRK再配置に対して翻訳が発生するかどうかを判断するのに役立ちます。

Activating neurotrophic tyrosine receptor kinase (NTRK) fusions, typically detected using nucleic-acid based assays, are highly targetable and define certain tumors. Here, we explore the utility of pan-TRK immunohistochemistry (IHC) to detect NTRK fusions. NTRK rearrangements were detected prospectively using MSK-IMPACT, a DNA-based next-generation sequencing assay. Transcription of novel NTRK rearrangements into potentially functional fusion transcripts was assessed via Archer Dx fusion assay. Pan-Trk IHC testing with mAb EPR17341 was performed on all NTRK rearranged cases and 20 cases negative for NTRK fusions on Archer. Of 23 cases with NTRK rearrangements, 15 had known activating fusions. Archer detected fusion transcripts in 6 of 8 novel NTRK rearrangements of uncertain functional significance. Pan-Trk IHC was positive in 20 of 21 cases with NTRK fusion transcripts confirmed by Archer. The discordant negative case was a mismatch repair- deficient colorectal carcinoma with an ETV6-NTRK3 fusion. All 20 additional Archer-negative cases had concordant pan-TRK IHC results. Pan-Trk IHC sensitivity and specificity for transcribed NTRK fusions was 95.2% and 100%, respectively. All positive IHC cases had cytoplasmic staining while the following fusion partner-specific patterns were discovered: all 5 LMNA-NTRK1 fusions displayed nuclear membrane accentuation, all 4 TPM3/4 fusions displayed cellular membrane accentuation, and half (3/6) of ETV6-NTRK3 fusions displayed nuclear staining. Pan-Trk IHC is a time-efficient and tissue-efficient screen for NTRK fusions, particularly in driver-negative advanced malignancies and potential cases of secretory carcinoma and congenital fibrosarcoma. Pan-Trk IHC can help determine whether translation occurs for novel NTRK rearrangements.